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anita55

银虫 (小有名气)

[求助] 为什么我在几何优化后原子数减少了,晶面位错?为什么不能做PDOS的图? 已有1人参与

本人学习castep一个月了,在尝试过程中有几个问题,希望大家帮助:
问题一: 为什么我几何优化从coarse到medium的过程中原子数减少了,并且晶面位错?怎么解决这个问题?
如图所示:

优化前


优化后

问题二: 我在计算DOS是,已经点击选择了“计算PDOS”的选项,为什么在分析的时候“PDOS"仍然不可选?

问题三: 如何做结构中某个元素,某个轨道的图呢?

像这样的。

大家帮帮忙吧,谢谢大家~~~~
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冲天飞龙

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-25 08:02:11
第一个问题,原子没变少。第一幅图中,有的原子恰好位于晶胞的边角上所以有重复显示,比如八个角上的其实是同一个原子。
第二个问题,按道理选了pdos就会算的,你最好把问题描述清楚点,另外看看运算得到的结果文件里有没有关于pdos的。
第三个问题,就是直接画某个原子的某个轨道的pdos就好了,MS里直接能实现。

发自小木虫IOS客户端
8楼2015-12-25 00:34:30
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binarec

木虫 (小有名气)

开始计算的时候选了利用对称性简化晶胞吧,这样出来的就是原胞了

发自小木虫Android客户端
7楼2015-12-25 00:06:09
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冲天飞龙

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
anita55: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 回答的超级好~~ 2015-12-25 14:55:56
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-25 15:56:20
引用回帖:
10楼: Originally posted by anita55 at 2015-12-25 13:37:08
感谢你的回答~我是个刚刚开始学习的本科生,能不能再麻烦您回答的详细一些呢?谢谢了~
第一个问题 你的意思是说这个优化过后这个结果没什么问题是吗,那么晶面的位错呢,也可以不用去管是吗?
第二个问题 我已经 ...

原子数量没问题,你可以把“properties explorer”打开,并选择system就可以清楚地看到体系中有多少个原子。
我不确定你说的晶面位错指的是什么,我看着绿色和红色原子的相对位置没什么变化啊,所以你的结果没有晶面位错,你要记着这些结构是有周期性边界条件的。
画pdos就是你选中某个原子,比如说O,然后在pdos界面有很多可以打勾的地方,比如s p d total,只把需要的钩上,然后就能生成了。例如选中O原子,pdos界面勾的是p,那么画的就是O 2p轨道

发自小木虫IOS客户端
12楼2015-12-25 14:25:55
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普通回帖

l量子晓忆

铁虫 (职业作家)

没选计算自旋,

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2015-12-24 11:35:10
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anita55

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by l量子晓忆 at 2015-12-24 11:35:10
没选计算自旋,

你指的是setup那里的spin polarized吗?我选了啊~
为什么我在几何优化后原子数减少了,晶面位错?为什么不能做PDOS的图?



发自小木虫IOS客户端
3楼2015-12-24 11:41:05
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bujiesan

新虫 (正式写手)

好好学物理!
4楼2015-12-24 12:19:08
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anita55

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by bujiesan at 2015-12-24 12:19:08
第一界面不能选Yes

不好意思,没明白,能具体说说吗?

发自小木虫IOS客户端
5楼2015-12-24 12:37:27
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l量子晓忆

铁虫 (职业作家)

不用优化,选能量算下看看,另外原子不能杂化,需为纯原子。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
6楼2015-12-24 20:57:49
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anita55

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by l量子晓忆 at 2015-12-24 20:57:49
不用优化,选能量算下看看,另外原子不能杂化,需为纯原子。

不能杂化什么意思,是我哪个选项选错了吗?
9楼2015-12-25 13:26:47
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anita55

银虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 冲天飞龙 at 2015-12-25 00:34:30
第一个问题,原子没变少。第一幅图中,有的原子恰好位于晶胞的边角上所以有重复显示,比如八个角上的其实是同一个原子。
第二个问题,按道理选了pdos就会算的,你最好把问题描述清楚点,另外看看运算得到的结果文件 ...

感谢你的回答~我是个刚刚开始学习的本科生,能不能再麻烦您回答的详细一些呢?谢谢了~
第一个问题 你的意思是说这个优化过后这个结果没什么问题是吗,那么晶面的位错呢,也可以不用去管是吗?
第二个问题 我已经解决啦,非常感谢,是我自己的问题,在分析DOS图的时候,我的xcd格式的文件不在激活状态,导致PDOS选项不可选。
第三个问题 能不能告诉我具体的操作呢,我看help文档也没看明白,麻烦您了~~
10楼2015-12-25 13:37:08
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