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螺旋技术

新虫 (正式写手)

应助: 3 (幼儿园)
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在线: 130.7小时
虫号: 928368
注册: 2009-12-15
专业: 生物化学

[求助] 转录组测序挖掘功能基因已有1人参与

如题，LZ现在想通过测转录组的方法挖据微生物中合成小分子化合物的功能基因（合成途径在其他物种中已知，但是自己研究的对象没有报道，也无参考基因组）

问题：1：单纯测转录组能不能达到要求；是否需要多准备几组样品？
      2：结果能发什么样的文章，不求点数；
      3：公司能否提供文章发表所需的所有图表？
      4：大家有无相关文献推荐？

提前感谢大家的宝贵意见。

回复此楼

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1楼 2015-12-21 14:34:44

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

幽幽深谷竹

金虫 (著名写手)

骨子里是文科男的理科男

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注册: 2009-11-30
性别: GG
专业: 生理生态学

【答案】应助回帖

楼主所做的实验有分组吗？处理组和对照组的区别有什么？
如果单纯测一种微生物的基因筛选合成小分子化合物的功能基因，而不涉及分组，建议做全基因组测序，了解该物种的基因全貌，然后分析。
如果有处理分组，那就做转录组，比较差异基因，进而分析得出结果。
这类发SCI没问题，IF高低看你的创新性和工作量，如果后续还有实验补进来，那3分以上没问题。
公司分析的话，图都很全的。
实不相瞒，我就是专门做测序和生信分析的，这点事对我来说很简单。

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