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loveleben

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】gaussian计算反应过渡态!

最近想用gaussian计算下反应过渡态,但不知初始结构如何确定,如分子的相对位置和原子之间的距离等,如高斯e8-03中,下面这些参数是如何确定的呢?这个问题已经困惑好久了,麻烦各位对过渡态优化有经验的朋友们多指教,谢谢!

0,1
O
C,1,1.13
H,2,1.1,1,164.0
H,3,1.3,2,90.0,1,0.
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eric88

木虫 (正式写手)

★ ★
loveleben(金币+2,VIP+0):thanks!
初始构型当然是反应物尽量远一些大于5-7AI以上,但是最主要的是要给出猜想的中间态构型,可以选择几个点估算一下大概可能的位置,分别计算能量3-5轮杀掉后采用逼近的原则靠近中间体,然后利用这个构型做QST3过渡态reasearch and irc检验反应路径。
2楼2008-09-24 17:00:51
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spkeey

金虫 (正式写手)


loveleben(金币+1,VIP+0):多谢!
1 经验,2 松散,3 一步一步调整。 无他法。
SPKEEY
3楼2008-09-24 20:50:18
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liaojinyun

铜虫 (小有名气)


loveleben(金币+1,VIP+0):xiexie!
QST2 也可以算出的,输入反应物和产物,会给你找出过度态的,1楼的方法也可以做,我没有做过。个人认为像这样比较简单的分子用经验输入结构 opt=(calcfc,ts,noeigen) freq ,irc, pc,rc确认更快些
4楼2008-09-24 21:18:14
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