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leew_wlee

银虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】xyz文件,其成键的信息格式

请问一下有谁知道xyz格式的文件,其两个粒子之间的成键信息的格式是什么样子的?知道的请举一下例子,感谢!

[ Last edited by woshilsh on 2009-6-13 at 23:04 ]
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wzslg

金虫 (著名写手)

★ ★
xuefei06(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎你多多关注计算综合版!
xyz格式的文件,就是笛卡儿坐标,例子如下

27
3-octanol
H    8.75072    -2.4733    2.54656
H    11.2604    -4.14431    3.82607
H    11.715    -5.8038    3.84934
H    11.6474    -4.95623    2.27507
C    11.1617    -5.07225    3.25095
H    9.33521    -5.55013    4.12477
H    9.62311    -6.44956    2.6051
O    9.21734    -3.19852    2.99613
C    9.69108    -5.46985    3.09219
H    9.29706    -4.35725    1.28281
C    8.91344    -4.40821    2.30845
H    7.16157    -4.71225    3.38853
H    7.20964    -5.67055    1.87836
H    6.99798    -2.66424    2.05897
C    7.40753    -4.68768    2.32166
H    6.90682    -3.59278    0.52793
C    6.63492    -3.58604    1.58988
H    5.00393    -3.82421    2.85921
H    4.78426    -4.66796    1.29681
H    4.87008    -1.67629    1.69415
C    5.12218    -3.74055    1.7737
H    4.51297    -2.47743    0.130426
C    4.37134    -2.52746    1.21631
H    2.72864    -2.48623    2.65878
H    2.41386    -3.49026    1.21167
C    2.88355    -2.56995    1.5779
H    2.35393    -1.6987    1.17539


第一行的27代表有27个原子,第二行的3-octanol是题目,随便写,不能缺省
我的QQ191094980
2楼2008-12-08 12:06:45
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州


mingdong(金币+1,VIP+0):谢谢!
用原子间的距离判断成键与否
3楼2008-12-08 12:43:34
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