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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » Material studio 中如何把斜晶胞转化为正交晶胞？
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brigsun

新虫 (初入文坛)

[求助] Material studio 中如何把斜晶胞转化为正交晶胞？ 已有1人参与

各位大侠高手，我用Amorphous Cell 构建一个聚合物的盒子，选了optimize cell，最后得到了一个斜交的盒子。
现在我想把斜交的盒子转变成一个正交的盒子，方便导出来用其他软件做MD，不知道在MS中怎样实现？
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1楼 2015-12-18 01:34:20
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felixtian

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by brigsun at 2015-12-18 16:51:48
对了，追问一下，在Amorphous Cell里面构建的盒子不是周期性的吗？...

可以算是周期性的，但是跟晶体点阵有点群对称的是不一样的。因为晶体点阵可以有多种形式的胞，例如说正交和非正交的胞。而amorphous的，一个胞就是一个原胞，因为里面原子杂乱无章。这种没有对称性的很难转化成其他的胞。就是原子点阵一定要有一些对称性才能转化晶胞，这是我的理解，不一定对，但希望有帮助。
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6楼2015-12-21 16:01:34
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felixtian

新虫 (初入文坛)
非周期性3d的没做过，感觉不好重构。
为什么不在开始不optimize cell呢？
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2楼2015-12-18 09:21:56
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brigsun

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by felixtian at 2015-12-18 09:21:56
非周期性3d的没做过，感觉不好重构。
为什么不在开始不optimize cell呢？

对于这个问题，不optimize cell是可以的，可以绕开这个问题。
但是，因为我之前也在MS中遇到类似的问题。MS中有很多自带的材料模型（比如沸石）都是斜晶胞，当时也想过把他们导出来，但是就是因为不知道怎么转化成正交cell而作罢。这次又遇到类似的问题，所以想找个解决方法。
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3楼2015-12-18 16:50:03
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brigsun

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by felixtian at 2015-12-18 09:21:56
非周期性3d的没做过，感觉不好重构。
为什么不在开始不optimize cell呢？

对了，追问一下，在Amorphous Cell里面构建的盒子不是周期性的吗？
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4楼2015-12-18 16:51:48
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