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brigsun

新虫 (初入文坛)

[求助] Material studio 中如何把斜晶胞转化为正交晶胞? 已有1人参与

各位大侠高手,我用Amorphous Cell 构建一个聚合物的盒子,选了optimize cell,最后得到了一个斜交的盒子。
现在我想把斜交的盒子转变成一个正交的盒子,方便导出来用其他软件做MD,不知道在MS中怎样实现?
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felixtian

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by brigsun at 2015-12-18 16:51:48
对了,追问一下,在Amorphous Cell里面构建的盒子不是周期性的吗?...

可以算是周期性的,但是跟晶体点阵有点群对称的是不一样的。因为晶体点阵可以有多种形式的胞,例如说正交和非正交的胞。而amorphous的,一个胞就是一个原胞,因为里面原子杂乱无章。这种没有对称性的很难转化成其他的胞。就是原子点阵一定要有一些对称性才能转化晶胞,这是我的理解,不一定对,但希望有帮助。
6楼2015-12-21 16:01:34
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felixtian

新虫 (初入文坛)

非周期性3d的没做过,感觉不好重构。
为什么不在开始不optimize cell呢?
2楼2015-12-18 09:21:56
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brigsun

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by felixtian at 2015-12-18 09:21:56
非周期性3d的没做过,感觉不好重构。
为什么不在开始不optimize cell呢?

对于这个问题,不optimize cell是可以的,可以绕开这个问题。
但是,因为我之前也在MS中遇到类似的问题。MS中有很多自带的材料模型(比如沸石)都是斜晶胞,当时也想过把他们导出来,但是就是因为不知道怎么转化成正交cell而作罢。这次又遇到类似的问题,所以想找个解决方法。
3楼2015-12-18 16:50:03
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brigsun

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by felixtian at 2015-12-18 09:21:56
非周期性3d的没做过,感觉不好重构。
为什么不在开始不optimize cell呢?

对了,追问一下,在Amorphous Cell里面构建的盒子不是周期性的吗?
4楼2015-12-18 16:51:48
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