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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps给一层原子（group）设置阻尼系数，使其成为缓冲层，吸收入射原子能量！
汕头大学海洋科学接受调剂
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feng0603

新虫 (小有名气)

[求助] lammps给一层原子（group）设置阻尼系数，使其成为缓冲层，吸收入射原子能量！ 已有1人参与

请问各位大神：本人研究原子碰撞，lammps中，怎么给一层原子（group）设置阻尼系数，使其成为一个缓冲层，吸收入射原子能量！
文献原文：The next one lattice unit above the bottommost layer is treated as an energy damping zone with the damping
coefficient of 0.4436 eV/ps 。
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1楼 2015-12-17 14:47:28
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yingxong2020

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by feng0603 at 2015-12-19 17:19:44
此贴问题已自己解决！谢谢！

能够把你的解决方法贴出来吗？ 可以帮助大家
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5楼2017-02-23 06:41:06
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jiaqz

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
feng0603: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-12-18 17:12:38
你只需要把这一层院子的BOND/ANGLE/DIHEDRAL参数定义好，然后选取合适的积分系综就可以了，不需要特别定义阻尼系数的。
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2楼2015-12-18 04:15:13
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feng0603

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaqz at 2015-12-18 04:15:13
你只需要把这一层院子的BOND/ANGLE/DIHEDRAL参数定义好，然后选取合适的积分系综就可以了，不需要特别定义阻尼系数的。

jiaqz！你好！谢谢你的回答！我这边模拟时，被轰击的原子间现在只有相互作用势（atom_style atomic），没有定义bond。你的意思是给原子用create bond命令增加bond，并设置合适的参数吗？但是我看来bond style中bond coef 单位都是(energy/distance^2)，而不是文献中提到的eV/ps 。我可能没有明白你的意思！能否说具体点呢？谢谢！
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3楼2015-12-18 17:29:31
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feng0603

新虫 (小有名气)
此贴问题已自己解决！谢谢！
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4楼2015-12-19 17:19:44
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