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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 求高人帮忙分析基因
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silviasj

金虫 (著名写手)

[交流] 求高人帮忙分析基因

P得淀粉酶基因如下，请高人帮忙分析成熟肽在哪。
TCGCTGGATTTTTATTGCTGTTTTATTTGGTTCTGGCAGGACCGGCGGCT
GCGAGTGCTGAAACGGCGAACAAATCGAATGAGCTTACAGCACCGTCGAT
CAAAAGCGGAACCATTCTTCATGCATGGAATTGGTCGTTCAATACGTTAA
AACACAATATGAAGGATATTCATGATGCAGGATATACAGCCATTCAGACA
TCTCCGATTAACCAAGTAAAGGAAGGGAATCAAGGAGATAAAAGCATGTC
GAACTGGTACTGGCTGTATCACCCGACATCGTATCAAATTGGCAACCGTT
ACTTAGGTACTGAACAAGAATTTAAAGAAATGTGTGCAGCCGCTGAAGAA
TATGGCATAAAGGTCATTGTTGACGCGGTCATCAATCATACCACCAGTGA
TTATGCCGCGATTTCCAATGAGGTTAAGAGTATTCCAAACTGGACACATG
GAAACACACAAATTAAAAACTGGTCTGATCGATGGGATGTCACGCAGAAT
TCATTGCTCGGGCTGTATGACTGGAATACACAAAATACACAAGTACAGTC
CTATCTGAAACGGTTCTTAGAAAGGGCATTGAATGACGGGGCAGACGGTT
TTCGATTTGATGCCGCCAAACATATAGAGCTTCCGGATGATGGGAGTTAC
GGCAGTCAATTTTGGCCGAATATCACAAATACATCTGCAGAGTTCCAATA
CGGAGAAATCCTGCAGGATAGTGCCTCCAGAGATGCTGCATATGCGAATT
ATATGGATGTGACAGCGTCTAACTATGGGCATTCCATAAGGTCCGCTTTA
AAGAATCGTAATCTGGGCGTGTCGAATATCTCCCACTATGCATCTGATGT
GTCTGCGGACAAGCTGGTGACATGGGTGGAGTCGCATGATACGTATGCCA
ATGATGATGAAGAGTCGACATGGATGAGCGATGATGATATCCGTTTAGGC
TGGGCGGTGATAGCTTCTCGTTCAGGCAGTACGCCTCTTTTCTTTTCCAG
ACCTGAGGGAGGCGGAAATGGTGTGAGATTCCCGGGGAAAAGCCAAATAG
GCGATCGCGGGAGTGCTTTATTTGAAGATCAGGCTATCACTGCGGTCAAT
AGATTTCACAATGTGATGGCTGGACAGCATGAGGAACTCTCGAACCCGAA
TGGAAACAACCAGATATTTATGAATCAGCGCGGCTCACATGGCGTTGTGC
TGGCAAATGCAGGTTCATCCTCTGTCTCTATCAATACGGCAACAAAATTG
CCTGATGGCAGGTATGACAATAAAGCTGGAGCGGGTTCATTTCAAGTGAA
CGATGGTAAACTGACAGGCACGATCAATGCCAGGTCTGTAGCTGTGCTTT
ATCCTGATGATATTGAAATCAGGTGTAACACATTCTTTCAATGATCAACT
GACGATTACCTTGCGTGCAAATGCGAATACAACAAAAGCCGTTTATCAAA
TCAATAATGGACCAGAGACGGCGTTTAAGGATGGAGATCAATTCACAATC
GGAAAAGGAGATCCATTTGGCAAAACATACACCATCATGTTAAAAGGAAC
GAACAGTGATGGTGTAACGAGGGCCGAGGAATACAGCTTTGTTAAAAGAG
ATCCAGCTTCGGCCAAAACCATCGGCTATCAAAATCCGAATCATTGGAGC
CAGGTAAATGCTTATATCTATAAACATGATGGGGGCCAGGCAATTGAATT
GACCGGATCTTGGCCTGGAAAACCAATGATTAAAAATGCAGATGGAATTT
ACACGCTGACACTGCCTGCGGACACGGATACAACCAACGCCAAAGTGATT
TTTAATAATGGCAGCGCCCAAGTGCCCGGCCAGAATCAGCCTGGCTTTGA
TTACGTGCAAAATGGTTA
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1楼 2008-09-23 00:11:51
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香菱儿

铁杆木虫 (著名写手)
您是通过什么方法得到的这个序列呢？请详细描述一下，我可以帮您初步分析一下。
或者我告诉您如何做。
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漫洒英雄泪，相离处士家。谢慈悲剃度在莲台下。没缘法转眼分离乍。赤条条来去无牵挂。那里讨烟蓑雨笠卷单行？一任俺芒鞋破钵随缘化！
2楼2008-09-23 09:34:16
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silviasj

金虫 (著名写手)
谢谢楼上的啊，我是通过PCR从枯草的基因组上获得的该基因。您还需要什么信息请加我QQ37894144~
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3楼2008-09-23 21:25:43
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sumertansy

铜虫 (小有名气)
有在线的信号肽分析软件，你可以搜一下，自己就可以分析了
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4楼2008-09-23 21:36:10
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silviasj

金虫 (著名写手)
楼上的 ，能推荐一个嘛？谢谢~
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5楼2008-09-23 21:46:57
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sumertansy

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
silviasj(金币+10,VIP+0):谢谢
http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
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6楼2008-09-23 21:57:32
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sumertansy

铜虫 (小有名气)
和枯草芽孢杆菌alpha-amylase一致性95%以上
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7楼2008-09-24 00:13:54
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sumertansy

铜虫 (小有名气)
楼主扩增的是编码区的一部分， 在5‘端应该还有39bp，显然没有起始密码子。3’端也少39bp，有意思。
分析成熟肽或信号肽最好是拿完整的基因。
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8楼2008-09-24 00:20:38
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