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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西

[交流] G03集群的大体方案

首先申明,我是在Ubuntu_Server_8.04上配置的。
我使用的是32位的PC机。

1  必须启动rsh 或者 ssh服务。
    以前,高斯默认的Linda并行库是通过rsh通讯的,但是我没有找到rsh软件包,虽然鸟哥关于这方面的配置和说明很全面的。 我安装的是openssh-server. 高斯也说了,推荐使用ssh作为各个节点之间的通讯方式。

2 NIS服务可以不必配置的。
   如果只是配置一个简单的用于G03的Cluster,可以不必启动这个或者安装这个该死的服务。 如果你认为你的机器嗷嗷牛逼,不怕影响运行效率的话! 但是如果不安装NIS服务,最好是这个Cluster是你一个人用,而且必须保证每个Node上面,具有相同的用户信息, 即相同的UID,GID。负责Linda并行不能通讯。

3 NFS 服务。
   如果是简单的Cluster,可以不使用这个服务。但是作为简单的Cluster,用于G03的, 如果不安装这个服务,必须保证每个节点上面的G03安装在相同的路径。 但是如果喜欢使用NFS的话,这样就不必在每个节点上面安装G03了,可以只把G03安装在主要的节点,然后用NFS共享这个G03路径。

4 带linda并行和版本有关。注意,据我所知道的,G03C02之前的版本,并不包含linda软体的。 但是在运行linda 之前,请注意先设置好linda的路径,并执行下面的命令:
export GAUSS_LFLAGS='-nodelist "node1 node02 node03"'.
注意,这个设置可以到Gaussian主页上面找到。
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Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
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ma_chao

新虫 (初入文坛)

可以直接在输入文件中通过%LindaWorker=node1,node2,这样方便每次用不同的节点来运行

呵呵,个人建议,仅供参考
2楼2008-09-25 14:25:36
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