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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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jysgg1015

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】优化求助,构型总是跑到一边

我优化2个构型的时候,构型总是优化到一边怎么办?
如附件所示,左边的能得到,右边的总是回到左边,谢谢

[ Last edited by jysgg1015 on 2008-9-23 at 15:07 ]
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男儿当自强!!!
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wxjbuilder

木虫 (知名作家)


gromacs(金币+1,VIP+0):谢谢指点
你把右边的那个H和O原子之间的距离固定一下,试一下看能否得出你想要的结构
然后再把它放开再优化一下
悠悠天地,奈何独立苍茫?
2楼2008-09-22 20:46:13
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jysgg1015

铁杆木虫 (著名写手)

这个方法我做过,优化后,放开后又回去啦。
男儿当自强!!!
3楼2008-09-22 22:05:53
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spkeey

金虫 (正式写手)

你把右边的C-C键往下掰。使其与苯环和另一个氧的夹角大些,让它从这个方向慢慢回去。氧上的氢掰向C-O -H直线。就可以了。
=============

呵呵,给你优化出来了 ,用的HF/6-31G ,看附件(大于512k了,传不了),分了俩段,自己看着接起来。chk可以自己重复作出来,可以在这个基础上加大基组。。。

[ Last edited by spkeey on 2008-9-23 at 10:39 ]
SPKEEY
4楼2008-09-23 10:08:33
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jysgg1015

铁杆木虫 (著名写手)

spkeey ,在么,我有事情想请你帮我忙,可以加我QQ下么?35416322。
男儿当自强!!!
5楼2008-09-23 11:15:45
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alick1102

铜虫 (小有名气)

右边的结构肯定是不稳定的,氨基旁边的C如果连接羟基的话,那它必须与苯环成双键,另外苯环上的氧也要与其相邻的C成双键才稳定。
1. 不要把氢朝向苯环上的那个氧
2.即使右边的结构优化到了,也是相当不稳定的。
到了博士的时候才知道,科学也不过是为了吃饭的。
6楼2008-09-23 12:24:53
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jysgg1015

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by alick1102 at 2008-9-23 12:24:
右边的结构肯定是不稳定的,氨基旁边的C如果连接羟基的话,那它必须与苯环成双键,另外苯环上的氧也要与其相邻的C成双键才稳定。
1. 不要把氢朝向苯环上的那个氧
2.即使右边的结构优化到了,也是相当不稳定的。

那怎么解决呢?我现在不管稳定与否,我想得到的是一个没有虚频的稳定构型。按照spkeey的确能优化出来,但是我想将氨基变成苯氨,还是出现一样的现象,解决不了。谢谢各位的帮忙!
男儿当自强!!!
7楼2008-09-23 15:06:28
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spkeey

金虫 (正式写手)

消虚频,这个很难哦。。。不稳定的就是不稳定阿。
同意  alick1102  的观点。没有办法。
SPKEEY
8楼2008-09-24 20:32:13
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liaojinyun

铜虫 (小有名气)

同意5楼的看法,从化学的电负性角度来解释,左边的下结构应该比右边的稳定
9楼2008-09-24 21:22:35
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