应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 学术交流区 » 论文投稿 » 论文写作 » 9
817/9返回列表首页上一页456789下一页
查看: 1101  |  回复: 80
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

yyc12596

新虫 (著名写手)
SIFT的结果貌似就是：Tolerated或者Damaging。要怎么查询啊，位置换算这么难
赞一下 回复此楼
61楼2015-12-19 16:30:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyc12596

新虫 (著名写手)
首先拿到蛋白的fasta序列

>sp|P14222|PERF_HUMAN Perforin-1 OS=Homo sapiens GN=PRF1 PE=1 SV=1
MAARLLLLGILLLLLPLPVPAPCHTAARSECKRSHKFVPGAWLAGEGVDVTSLRRSGSFP
VDTQRFLRPDGTCTLCENALQEGTLQRLPLALTNWRAQGSGCQRHVTRAKVSSTEAVARD
AARSIRNDWKVGLDVTPKPTSNVHVSVAGSHSQAANFAAQKTHQDQYSFSTDTVECRFYS
FHVVHTPPLHPDFKRALGDLPHHFNASTQPAYLRLISNYGTHFIRAVELGGRISALTALR
TCELALEGLTDNEVEDCLTVEAQVNIGIHGSISAEAKACEEKKKKHKMTASFHQTYRERH
SEVVGGHHTSINDLLFGIQAGPEQYSAWVNSLPGSPGLVDYTLEPLHVLLDSQDPRREAL
RRALSQYLTDRARWRDCSRPCPPGRQKSPRDPCQCVCHGSAVTTQDCCPRQRGLAQLEVT
FIQAWGLWGDWFTATDAYVKLFFGGQELRTSTVWDNNNPIWSVRLDFGDVLLATGGPLRL
QVWDQDSGRDDDLLGTCDQAPKSGSHEVRCNLNHGHLKFRYHARCLPHLGGGTCLDYVPQ
MLLGEPPGNRSGAVW
赞一下 回复此楼
62楼2015-12-19 17:26:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyc12596

新虫 (著名写手)
??????????https://sift.jcvi.org/
??single protein tools??????SIFT sequence?????÷?ò???????????á????????
W129R
>sp|P14222|PERF_HUMAN Perforin-1 OS=Homo sapiens GN=PRF1 PE=1 SV=1
MAARLLLLGILLLLLPLPVPAPCHTAARSECKRSHKFVPGAWLAGEGVDVTSLRRSGSFP
VDTQRFLRPDGTCTLCENALQEGTLQRLPLALTNWRAQGSGCQRHVTRAKVSSTEAVARD
AARSIRNDRKVGLDVTPKPTSNVHVSVAGSHSQAANFAAQKTHQDQYSFSTDTVECRFYS
FHVVHTPPLHPDFKRALGDLPHHFNASTQPAYLRLISNYGTHFIRAVELGGRISALTALR
TCELALEGLTDNEVEDCLTVEAQVNIGIHGSISAEAKACEEKKKKHKMTASFHQTYRERH
SEVVGGHHTSINDLLFGIQAGPEQYSAWVNSLPGSPGLVDYTLEPLHVLLDSQDPRREAL
RRALSQYLTDRARWRDCSRPCPPGRQKSPRDPCQCVCHGSAVTTQDCCPRQRGLAQLEVT
赞一下 回复此楼
63楼2015-12-19 17:44:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyc12596

新虫 (著名写手)
数据提交不成功，重复刷页。
赞一下 回复此楼
64楼2015-12-19 21:27:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyc12596

新虫 (著名写手)
SIFT
Amino acids with probabilities < 0.05 are predicted to be deleterious.
赞一下 回复此楼
65楼2015-12-19 22:19:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyc12596

新虫 (著名写手)
TOLERATED with a score of 0.30
赞一下 回复此楼
66楼2015-12-19 22:23:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyc12596

新虫 (著名写手)
总算把SIFT刷出来了。

接下来改正文。低下的工作效率。
赞一下 回复此楼
67楼2015-12-20 15:19:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyc12596

新虫 (著名写手)
先从Background改起。
赞一下 回复此楼
68楼2015-12-20 16:55:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyc12596

新虫 (著名写手)
Background改完。
改Method部分。
赞一下 回复此楼
69楼2015-12-20 17:11:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyc12596

新虫 (著名写手)
Method改完。
改Result部分。
赞一下 回复此楼
70楼2015-12-20 18:01:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yyc12596 的主题更新
817/9返回列表首页上一页456789下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 3/150 2026-11-05 21:05 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 8/400 2026-11-05 20:54 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 8/400 2026-11-05 20:54 by qL1cU46YIdK0
[基金申请] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 8/400 2026-11-05 20:45 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 8/400 2026-11-05 20:43 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 9/450 2026-11-05 20:34 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 8/400 2026-11-05 20:21 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 11/550 2026-11-05 20:10 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-05 20:10 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 6/300 2026-11-05 18:00 by My20PsvIExYO
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 13/650 2026-11-05 17:47 by My20PsvIExYO
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 14/700 2026-11-05 17:36 by My20PsvIExYO
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 10/500 2026-11-05 17:36 by My20PsvIExYO
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 9/450 2026-11-05 17:26 by My20PsvIExYO
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 16/800 2026-11-05 17:25 by My20PsvIExYO
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 13/650 2026-11-05 17:15 by My20PsvIExYO
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-05 15:46 by My20PsvIExYO
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-05 11:10 by PYZmcHr5kSaq
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 10/500 2026-11-05 10:39 by PYZmcHr5kSaq
[基金申请] 各位基础老师们，看完中央《从严治党》的决定后，对学术界更加有信心了吧 +5 iaeyuan 2026-11-01 5/250 2026-11-04 14:43 by jinchengzi
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭