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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

[交流] Gaussian03的O3LYP是错的

截至目前,所有用Gaussian03作的O3LYP计算,结果都是错的。DFT专家Truhlar的小组早在04年就发现Gaussian 03的O3LYP有问题,无法重复O3LYP文献里的标准结果。见

Phys. Chem. Chem. Phys., 2004, 6, 673 - 676,
Tests of second-generation and third-generation density functionals for thermochemical kinetics
Yan Zhao, Jingzhi Pu, Benjamin J. Lynch and Donald G. Truhlar

不过文章没给出解决办法。通过分析源代码,发现O3LYP的这个BUG隐藏得很深。OPTX和Slater交换泛函最初的因子是正确的,但不知在什么位置发生了改变,因此需要用IOP指令重新覆盖OPTX和Slater的因子:

# o3lyp IOP(3/77=0813309262)

改后的O3LYP可以给出与其他程序一致的结果。测试结果见

http://bbs.zixia.net/disparticle ... ;ID=36527&pos=7
[search]O3LYP[/search]
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beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
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wxjbuilder

木虫 (知名作家)

多谢指教
能不能介绍一下O3LYP与B3LYP有啥区别?优缺点?
悠悠天地,奈何独立苍茫?
2楼2008-09-22 20:52:38
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

主要差别有两处。一是交换泛函不同,OPTX是一种改良的Beck 88泛函,从理论上讲要更准确(从实用角度可能未必如此)。二是HF精确交换的因子不同,几乎是1:2的关系。对主族元素构成的体系可能区别不大,对于过渡元素,特别是一些电子相关能比较强的3d金属,计算结果对HF因子有很强的依赖性,O3LYP和B3LYP的结果有可能完全不同。

其他交换、相关项以及不同的因子,造成的差别通常不大。
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
3楼2008-09-22 22:32:13
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

IOP(3/77=0813309262)可以用于gaussian03.b.03,c.01,c.02(估计其他的b.0x版本也都可以),但是对于d.01无效。对于gaussian03的其他版本,可以运行这个F离子的测试:

# cc-pvtz IOp(3/74=-24) IOP(3/77=0813309262)

-1 1
F

如果计算的能量在-99.6980... Hartree左右,说明指定IOP(3/77=0813309262)后的O3LYP是对的。

O3LYP的结构优化+频率计算还有个问题。opt和freq要分开计算,写成两个输入文件,或定义两步任务。要是写在一起,由于gaussian的另一个bug,导致输入的IOP(3/77=0813309262)无法传递到freq计算中,因此在频率步骤中计算的能量、梯度、力常数、偶极矩等,都是错的。

[ Last edited by beefly on 2008-10-5 at 10:57 ]
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
4楼2008-10-05 07:41:17
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


不妨将此问题投到CCL上讨论
5楼2008-10-05 08:54:20
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

我以前的单位买了gaussian的site license,我有帐号,能用,但不知道是否合法。现在的单位是上了gaussian的黑名单的。而且测试的gaussian03版本太多了。去ccl讨论,弄不好会给自己惹麻烦。

[ Last edited by beefly on 2008-10-5 at 10:23 ]
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
6楼2008-10-05 10:19:23
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