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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » [求助]氢键的界定标准是什么呢
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gaohongmei128

金虫 (小有名气)

[交流] [求助]氢键的界定标准是什么呢

[求助]氢键的界定标准是什么呢？
      由于算得是有机大分子，识别H2PO4-，氢键作用点挺多的，想问问C-H...O的距离和键角要在那个范围内才可以算是形成了氢键呢？

     比方说键角为95.9，O-H....O中的H...O距离为2.09埃，可以认为形成了强的氢键吗？、

    谢谢期待高手的指点！
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1楼 2008-09-21 10:07:07
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gromacs

银虫 (正式写手)
几何判据  0.35 nm  30 degree
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"I was taught at school that you should never start a sentence without knowing the end of it." GROMACS讨论区：http://www.mdbbs.org/forum-39-1.html
4楼2008-09-23 00:56:00
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mengxianggao

木虫 (正式写手)

新手
★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
从CSD大部分晶体结构数据信息来看，算是中等偏强的氢键。
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新手学习
2楼2008-09-21 11:01:00
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ustc

金虫 (著名写手)
★
灯塔守望者(金币+1,VIP+0):谢谢支持小木虫
G.  A.  Jeffrey,  An  introduction  to  hydrogen  bonding,  Oxford  University  Press,
Oxford, 1997.

这本书对hydrogen bond 的分类介绍很详细！
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5楼2008-09-23 08:20:43
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spkeey

金虫 (正式写手)
我用AIM来判断。很准确
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SPKEEY
6楼2008-09-23 09:19:54
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