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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 转录组学大神 求助，急急急
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whhj1030

金虫 (小有名气)

[求助] 转录组学大神 求助，急急急 已有2人参与

我投了一篇转录组学的文章，审稿人提了个奇葩问题:   ‘clean data’, ‘clean read’ are not scientific terminology. Please do not use slang here and elsewhere.
  原文是这样：Raw data (raw reads) of fastq format were firstly processed through in-house perl scripts. In this step, clean data (clean reads) were obtained by removing reads containing adapter, reads containing ploy-N and low quality reads from raw data.

我该如何解释或者修改？？？？

另外，DEG是不是DEG (Differentially Expressed Gene)？？

谢谢大家
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1楼 2015-12-08 16:25:32
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whhj1030

金虫 (小有名气)
大神们去哪里了？
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2楼2015-12-08 20:07:01
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翼在天

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

你好，我近期也准备做转录组学，想跟楼主打听一下楼主的转录组的数据是在哪做的？
现在跟华大、诺禾致源还有上海伯豪生物科技在询问，不知道哪家的好些？
另外，楼主的这个问题，可以参考一下其他的做RNA-seq的文献啊，看看别人都怎么写的呗~
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3楼2016-01-07 15:33:26
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he龙行天下

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

给你个参考的文件，里边有专业的描述，改改就行了。另外表达差异好像不是用DEG来表示的。
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  • 附件 1 : Methods_MedTR.pdf
    • 2016-01-08 12:15:05, 74.69 K
4楼2016-01-08 12:16:28
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he龙行天下

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 翼在天 at 2016-01-07 15:33:26
你好，我近期也准备做转录组学，想跟楼主打听一下楼主的转录组的数据是在哪做的？
现在跟华大、诺禾致源还有上海伯豪生物科技在询问，不知道哪家的好些？
另外，楼主的这个问题，可以参考一下其他的做RNA-seq的文 ...

不知道你在哪呢，最好能找在本地的公司，这样后期咨询起来比较方便。上海，我们课题组选择的是上海欧易生物，后期服务的相当好
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5楼2016-01-08 12:19:11
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