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luqing6879

木虫 (著名写手)

[求助] 如果通过笛卡尔坐标确定分子点群? 已有2人参与

现在计算的是一个分子通式为AB4型的分子。在笛卡尔坐标C1点群下优化计算频率可以看到有简并的频率存在。通过可视化软件可以看到分子近似于Td点群。所以认为分子只可能采取Td,D2d或C3v中的一种。

然而当采用z矩阵坐标重新优化计算频率时,不论Td或D2d点群都给出两个虚频。

请问该如何确定这个分子的点群呢?

谢谢。
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
1、先把分子按照点群对称好,再用symm=pg=point group限制最高点群。
2、你的两个虚频多大?很小的话可以考虑换方法基组等,可能虚频就没有了。
3、如果内坐标优化不出来,我不知道换笛卡尔是否有用,你可以用opt=cartesian来限制。。。
4、用modredundant扫描势能面,看能量变化。
2楼2015-12-08 08:29:43
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

开壳层分子吧?
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
3楼2015-12-08 11:15:02
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luqing6879

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by beefly at 2015-12-08 11:15:02
开壳层分子吧?

嗯。是的。忘了说了 -_-!,双重态。
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4楼2015-12-08 11:21:02
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luqing6879

木虫 (著名写手)

更新一下,现在用另一个软件chemcraft“识别”点群并生成相应的z矩阵坐标(这里是生成D2d点群的z矩阵)。在C1对称性下得到全实的频率,优化后的坐标参数是
  R12=                 2.09053704 ANG
  A213=               99.36784889 DEGREE
  A314=              114.73317695 DEGREE
  D2314=             122.88817885 DEGREE
  A215=              114.73316130 DEGREE
  D3215=             122.88810149 DEGREE

geometry={
La1
F1,la1,R12
F2,la1,R12,f1,A213
F3,la1,R12,f2,A314,f1,D2314
F4,la1,R12,f1,A215,f2,D3215
}


但是当我试图使A314=A215, 并且使D2314=D3215时,程序只能将其识别为C2点群。

怎么改才能变成D2d点群呢?

谢谢。
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5楼2015-12-08 13:30:24
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

引用回帖:
4楼: Originally posted by luqing6879 at 2015-12-08 11:21:02
嗯。是的。忘了说了 -_-!,双重态。...

如果开壳层的基态存在简并,由于jahn-teller效应,导致简并态其中的一支的能量下降,对称性可能降低,于是在高对称构型下出现虚频
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
6楼2015-12-08 16:13:43
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luqing6879

木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by beefly at 2015-12-08 16:13:43
如果开壳层的基态存在简并,由于jahn-teller效应,导致简并态其中的一支的能量下降,对称性可能降低,于是在高对称构型下出现虚频...

对哦,让我来想一想。非常非常感谢。再来应助一下吧,我把金币转给你。(虽然我知道你完全不在乎哈)
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7楼2015-12-09 05:20:20
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
luqing6879: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 谢谢。不过奇怪了,系统怎么不给我消息提醒了? -_-! 2015-12-10 05:50:33
如果jahn-teller效应比较弱,低对称构型可能和高对称构型的能量和结构有可能非常接近
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
8楼2015-12-09 09:44:10
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燕飞晴空

新虫 (初入文坛)

您好,我想问下了解sqs么

发自小木虫Android客户端
9楼2017-04-25 17:14:46
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