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suomary

铜虫 (初入文坛)

[求助] VESTA有些原子不显示 已有2人参与

结构施加应变后,再用VESTA打开,晶胞不完整,如下图,怎么显示全部原子?

VESTA有些原子不显示
捕获.PNG
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凌云志123

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
suomary: 金币+1, 有帮助 2015-12-08 18:40:22
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-12 13:46:05
不太可能实现你想要的结果,应该是优化过程中某些原子的对称性跑没了
2楼2015-12-08 16:27:24
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suomary

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 凌云志123 at 2015-12-08 16:27:24
不太可能实现你想要的结果,应该是优化过程中某些原子的对称性跑没了

那这个软件有很大缺陷啊

发自小木虫Android客户端
3楼2015-12-08 18:41:11
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人人余yan

金虫 (著名写手)

可以优化前整体平移原子位置,看上去对称些,

发自小木虫Android客户端
4楼2015-12-08 18:45:08
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kjsun

木虫 (正式写手)

哪里缺原子啊?
5楼2015-12-09 17:14:00
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llh2010

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
suomary: 金币+3, ★★★很有帮助 2015-12-09 23:30:04
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-12 13:46:11
这个问题好像论坛里问过很多遍了吧。不显示的原因是一些原子优化后中心位置被挤到晶胞外面去了,而你只显示一个晶胞的话当然是不显示了,如果想在一个晶胞里显示被挤出去的原子,在boundary里把x,y,z的最小值设置成负零点几,最大值设置成一点几,就会显示了。至于这个 点几 根据实际情况设。
知识引导人生,学习成就未来
6楼2015-12-09 21:30:06
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凌云志123

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by suomary at 2015-12-08 18:41:11
那这个软件有很大缺陷啊
...

没有缺陷,就是优化造成的某些原子位置变化较大,比如0 0 0 原子,本来显示八个,结果可能只一个,
7楼2015-12-09 22:02:13
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