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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » VESTA有些原子不显示
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suomary

铜虫 (初入文坛)

[求助] VESTA有些原子不显示 已有2人参与

结构施加应变后，再用VESTA打开，晶胞不完整，如下图，怎么显示全部原子？

VESTA有些原子不显示
捕获.PNG
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1楼 2015-12-07 23:57:45
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凌云志123

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
suomary: 金币+1, ★有帮助 2015-12-08 18:40:22
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-12 13:46:05
不太可能实现你想要的结果，应该是优化过程中某些原子的对称性跑没了
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2楼2015-12-08 16:27:24
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suomary

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 凌云志123 at 2015-12-08 16:27:24
不太可能实现你想要的结果，应该是优化过程中某些原子的对称性跑没了

那这个软件有很大缺陷啊

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3楼2015-12-08 18:41:11
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人人余yan

金虫 (著名写手)
可以优化前整体平移原子位置，看上去对称些，

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4楼2015-12-08 18:45:08
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kjsun

木虫 (正式写手)
哪里缺原子啊？
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5楼2015-12-09 17:14:00
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llh2010

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
suomary: 金币+3, ★★★很有帮助 2015-12-09 23:30:04
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-12 13:46:11
这个问题好像论坛里问过很多遍了吧。不显示的原因是一些原子优化后中心位置被挤到晶胞外面去了，而你只显示一个晶胞的话当然是不显示了，如果想在一个晶胞里显示被挤出去的原子，在boundary里把x，y，z的最小值设置成负零点几，最大值设置成一点几，就会显示了。至于这个 点几 根据实际情况设。
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知识引导人生，学习成就未来
6楼2015-12-09 21:30:06
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凌云志123

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by suomary at 2015-12-08 18:41:11
那这个软件有很大缺陷啊
...

没有缺陷，就是优化造成的某些原子位置变化较大，比如0 0 0 原子，本来显示八个，结果可能只一个，
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2015-12-09 22:02:13
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