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linnaliu

新虫 (小有名气)

[交流] 算了一天结构优化,竟然才走了12离子步

求助,如下图所示,这是我跑了一天的OUTCAR的时间表,不清楚为什么72个原子,竟然能跑那么久,但才走了12个离子步,求支招,算的太慢了,36核,进行TiO2(001)参杂Mn的结构优化,算的太慢了。

算了一天结构优化,竟然才走了12离子步


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dxcharlary

专家顾问 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
16个核一个节点,为什么要用36个核?你用32个核都比你这个快,另外NPAR等并行参数对运行时间非常重要。
11楼2015-12-09 20:21:45
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查看全部 12 个回答

123dingyc

新虫 (知名作家)

4楼2015-12-06 21:34:34
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cavediger

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你这截图没提供啥信息,只能猜
1.是否跨节点?若是,走的是IB网还是千兆网?如果没有IB网,最好不要跨节点!有了IB网,还要有合适的MPI,像MPICH2之类的根本不支持IB网,最好换intelMPI
2.查看你作业的内存使用情况,如果内存占满且又使用了大量的SWAP,那基本没指望了,解决的办法要么加物理内存,要么降低计算精度,少取点k点,或降低cutoff
3.验证你编译的程序是否有问题
4.如果一个节点能算动的问题,最好别跨节点,VASP并不是计算核心越多就一定快
我们都老得太快,却聪明得太迟。当我一路跌跌撞撞登上山巅,蓦然发现,本来就有一条笔直的路,直达山顶....
5楼2015-12-06 22:25:33
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474029625

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个,什么都没有,怎么说呀。。
6楼2015-12-07 10:14:21
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