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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 算了一天结构优化，竟然才走了12离子步
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linnaliu

新虫 (小有名气)

[交流] 算了一天结构优化，竟然才走了12离子步

求助，如下图所示，这是我跑了一天的OUTCAR的时间表，不清楚为什么72个原子，竟然能跑那么久，但才走了12个离子步，求支招，算的太慢了，36核，进行TiO2（001）参杂Mn的结构优化，算的太慢了。

算了一天结构优化，竟然才走了12离子步


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1楼 2015-12-06 20:33:11
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linnaliu

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by cavediger at 2015-12-06 22:25:33
你这截图没提供啥信息，只能猜
1.是否跨节点？若是，走的是IB网还是千兆网？如果没有IB网，最好不要跨节点！有了IB网，还要有合适的MPI，像MPICH2之类的根本不支持IB网，最好换intelMPI
2.查看你作业的内存使用情 ...

好像真的是节点的问题，服务器设置的是16核一个节点，我设NPAR=2，我又用了36核。是不是设核数的时候，要尽量把服务器的一个节点占满，会比较快啊

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10楼2015-12-08 00:38:12
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123dingyc

新虫 (知名作家)
不清楚

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4楼2015-12-06 21:34:34
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cavediger

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你这截图没提供啥信息，只能猜
1.是否跨节点？若是，走的是IB网还是千兆网？如果没有IB网，最好不要跨节点！有了IB网，还要有合适的MPI，像MPICH2之类的根本不支持IB网，最好换intelMPI
2.查看你作业的内存使用情况，如果内存占满且又使用了大量的SWAP，那基本没指望了，解决的办法要么加物理内存，要么降低计算精度，少取点k点，或降低cutoff
3.验证你编译的程序是否有问题
4.如果一个节点能算动的问题，最好别跨节点，VASP并不是计算核心越多就一定快
赞一下(2人) 回复此楼
我们都老得太快，却聪明得太迟。当我一路跌跌撞撞登上山巅，蓦然发现，本来就有一条笔直的路，直达山顶....
5楼2015-12-06 22:25:33
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474029625

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这个，什么都没有，怎么说呀。。
赞一下 回复此楼
6楼2015-12-07 10:14:21
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