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sheep916628

新虫 (小有名气)

[求助] 关于高斯计算配合物结构和能量中出现的问题(配位键变成了实键) 已有2人参与

打算用高斯09算一个含铜配合物的结构和能量,图1是计算好的配合物的构型,中间肉色的是Cu原子,图2图3是用到的计算参数,原始结构图如图4所示,发现原先配合物中的配位键变成了实键,还有发生断裂的情况,请问是不是我原始结构图搭错了还是我计算参数出现了问题?谢谢各位,求帮助啊~~~

关于高斯计算配合物结构和能量中出现的问题(配位键变成了实键)


关于高斯计算配合物结构和能量中出现的问题(配位键变成了实键)-1
3.png


关于高斯计算配合物结构和能量中出现的问题(配位键变成了实键)-2
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关于高斯计算配合物结构和能量中出现的问题(配位键变成了实键)-3
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深浅蓝色的鱼

铁虫 (初入文坛)

我想算个银和多肽的配位,请问用什么基组。。感觉好糊涂,我需要用虚键么?还是直接放那里 让优化,然后计算能量?
23楼2016-10-14 17:13:01
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sheep916628

新虫 (小有名气)

困扰了我快1礼拜了- -求帮助啊,各位
2楼2015-12-04 10:48:42
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三方石墨

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-05 15:09:34
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-05 15:10:06
sheep916628: 金币+5, 有帮助, 谢谢说明 2015-12-07 14:57:30
没有问题,高斯默认:当键长较短时画做实键,高于一个设定值(常见中心离子配合物一般2埃多点)时,不显示键。
楼主可以回想一下高斯的输入文件,只是定义了各个原子初始位置,有没有键都一样,只是高斯把原子之间力大的画了个键方便你理解罢了。
顺带一说,B3LYP算配合物键长会偏长较多。

发自小木虫Android客户端
6楼2015-12-05 12:26:04
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474029625

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
sheep916628: 金币+5, 有帮助, 这个结构是肯定存在的,搭好模型后显示的也是电中性 2015-12-07 15:02:11
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-12 13:44:28
首先,请确认一下是不是Doublet,还有到底带不带电
其次,请至少使用6-31G(d),里面有Cu,不知道是不是应该用ECP
建议Calculate Force 取 Once,结构能够比较快的收敛。
最后,请务必确认结构的合理性合法性,如果在算一个没有意义的结构,结果是没有意义的。
7楼2015-12-07 10:20:57
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