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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » ms建模的细节问题探究
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橙子学术

银虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by jingbobobo at 2015-11-28 10:21:02
对称性里面有个make p1，点下这个再删除试试，碳纳米管不太清楚
...

好的，谢谢！
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11楼2015-11-28 15:18:06
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
6楼: Originally posted by jingbobobo at 2015-11-27 20:58:33
谢谢，可以计算了，但我感觉模型还是存在问题，建模过程如下：石墨狭缝是导入的石墨结构再做的超晶胞，再用Amorphous cell建立气体分子晶胞，最后两者组合跑分子动力学，这样对不对啊？
...

这个我不清楚，你最好看看有没有类似的文献，可以参考下文献里的操作方法
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
12楼2015-11-30 10:35:44
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jingbobobo

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
12楼: Originally posted by pigrass at 2015-11-30 10:35:44
这个我不清楚，你最好看看有没有类似的文献，可以参考下文献里的操作方法...

谢谢，文献里面就是这么做的，可是我总感觉气体分子和石墨狭缝之间的没有相互作用，就只有气体分子在单独跑分子动力学，怎么检查石墨也被赋予了力场啊
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13楼2015-11-30 11:09:10
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
13楼: Originally posted by jingbobobo at 2015-11-30 11:09:10
谢谢，文献里面就是这么做的，可是我总感觉气体分子和石墨狭缝之间的没有相互作用，就只有气体分子在单独跑分子动力学，怎么检查石墨也被赋予了力场啊...

你可以在动力学结果的xsd或者xtd中选择一个原子，查看他的属性里forcefield type有没有值

其实如果有原子没有分配到力场，动力学会出错的
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
14楼2015-11-30 13:49:05
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wjj318

金虫 (小有名气)
引用回帖:
14楼: Originally posted by pigrass at 2015-11-30 13:49:05
你可以在动力学结果的xsd或者xtd中选择一个原子，查看他的属性里forcefield type有没有值

其实如果有原子没有分配到力场，动力学会出错的...

大神！！！！！！
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15楼2015-12-22 14:50:07
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Ronny_chou

木虫 (正式写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by jingbobobo at 2015-11-30 11:09:10
谢谢，文献里面就是这么做的，可是我总感觉气体分子和石墨狭缝之间的没有相互作用，就只有气体分子在单独跑分子动力学，怎么检查石墨也被赋予了力场啊...

通过查看其比表面积发现创建的晶胞其比表面积为零，不知道你是不是也是这种情况，你的问题得到解决了吗现在~
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16楼2016-06-16 16:52:38
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