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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » K 点收敛性测试comment文件无能量输出
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默默七月

新虫 (小有名气)

[求助] K 点收敛性测试comment文件无能量输出 已有1人参与

如题，进行K 点收敛性测试comment文件无能量输出，按的是侯老师教程写的脚本，提交命令也改成自己的。下面是comment文件
7 0.000000
9 0.000000
11 0.000000
13 0.000000
15 0.000000
17 0.000000
19 0.000000
脚本文件
cd $PBS_O_WORKDIR
NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l`
echo $PBS_O_WORKDIR
#!/bin/sh
rm WAVECAR
for i in  7 9 11 13 15 17 19
do
cat >KPOINTS <<!
Automatic generation
0
Monhkorst-Pack
$i  $i  1
0.0 0.0 0.0
!
echo "k mesh= $i x $i x " ; mpirun -np $NP -machinefile $PBS_NODEFILE /public2/home/wuli/liupei5134/bin/vasp53
KP=`grep "irreducible" OUTCAR|tail -1 |awk '{printf"%12.6f\n",$5}'`
echo $i $KP $E >>comment
done
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1楼 2015-11-24 14:16:57
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g_wcai

木虫 (正式写手)

开心

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-01 21:12:58
这个问题可能遇到过，相当于提交了几个不同k点设置的计算，你的comment出来时，你去查看一下你提交的任务完成了吗？任务没完成出来的ENErGe当然为零！！！

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
哈哈，笑口常开！
2楼2015-11-24 15:59:07
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默默七月

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by g_wcai at 2015-11-24 15:59:07
这个问题可能遇到过，相当于提交了几个不同k点设置的计算，你的comment出来时，你去查看一下你提交的任务完成了吗？任务没完成出来的ENErGe当然为零！！！

谢谢，但是我的任务计算完成了，请问还有其他原因吗
赞一下 回复此楼
3楼2015-11-24 16:51:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

g_wcai

木虫 (正式写手)

开心

【答案】应助回帖

★
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-01 21:13:04
那你查看一下Outcar中能量是多少，如果是o，就有可能你的程序有问题！

发自小木虫Android客户端
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哈哈，笑口常开！
4楼2015-11-24 17:17:32
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默默七月

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by g_wcai at 2015-11-24 17:17:32
那你查看一下Outcar中能量是多少，如果是o，就有可能你的程序有问题！

好的，谢谢
回复此楼
5楼2015-11-24 18:22:36
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g_wcai

木虫 (正式写手)

开心

【答案】应助回帖

★
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-01 21:13:12
还有，你程序中KP=`grep "irreducible" OUTCAR|tail -1 |awk '{printf"%12.6f\n",$5}'`这个语句是不是取能量值？！
如果是可能有问题，irreducible是什么能量？一般用grep "TOTEN" OUTCAR！
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哈哈，笑口常开！
6楼2015-11-24 20:56:11
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andyhox

铜虫 (初入文坛)
mpirun -np $NP -machinefile $PBS_NODEFILE /public2/home/wuli/liupei5134/bin/vasp53
请问这一行是什么意思   新手小白
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7楼2019-03-14 20:03:31
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