| 查看: 2080 | 回复: 0 | ||
shijunqin木虫 (小有名气)
|
[求助]
msi2lmp导入MS模型进入lammps时出错“bash: msi2lmp.exe: command not found”
|
|
lammps新手求助 我按照以下【】里的方法进行操作的，可是到第二步的第4条终端执行时，就出错，只生成一个空的data.文件，并没有.lammps05文件生成，提示错误 bash: msi2lmp.exe: command not found，如上传图片所示。我该如何做？请诸位大神指点啊 【一、编译 直接在 ./lammps/tools/msi2lmp/src/文件下make就ok， 生成msi2lmp.exe执行文件； 二、使用 1，直接把msi2lmp.exe拷贝到指定文件夹下（最好单独一个）； 2，在ms中建立好结构模型后，在ds模块或者forcite模块中指定力场类型，如对xxx结构指定为cvff力场（这一块看你需要，人工或自动指定），并根据你的需要删除或者改变一些结构信息（如删除键长，改变某些原子的力场类型，在ms中比较容易实现）（这样做的目的是为了少在lammps的data文件中做修改），export结构保存为.car格式，同时自动有.mdf格式的文件生成（mdf文件中保存有对应的力场参数信息，如上面的cvff力场）； 3，将xxx.car和xxx.mdf文件拷贝到msi2lmp.exe所在的文件夹，并将tools/msi2lmp/biosym_frc_files文件中对应的力场文件拷贝到这个文件夹中（如上面的cvff.frc）（很多朋友在转化过程中报错找不到力场信息就是这个原因，没有力场文件来解释.mdf文件，lmp自带的力场文件和ms中的力场文件一模一样，所以这一步很关键，一定记住你在ms中给结构指定力场时用的那种力场，在这就拷贝那种力场，我一般就用cvff，呵呵足够了）； 4，在这个文件目录下，通过终端命令行./msi2lmp.exe xxx -class I -frc cvff > data.xxx 运行程序，运行成功生成data.xxx文件和xxx.lammps05文件，data.xxx是空的可以直接删除，数据在xxx.lammps05文件中。 5，在xxx.lammps05文件中修改力场参数（把自己的数据加进去），ok！】  123.jpg |
回复此楼» 猜你喜欢
材料科学与工程320求调剂，080500
已经有4人回复
-
0703调剂，一志愿天津大学319分
已经有17人回复
-
一志愿211，0703化学305分求调剂
已经有5人回复
-
0703化学调剂 348分
已经有6人回复
-
273求调剂
已经有11人回复
-
308求调剂
已经有5人回复
-
材料与化工363求推荐
已经有11人回复
-
材料调剂
已经有12人回复
-
生物学调剂 可调剂到生物与医药
已经有3人回复
-
304求调剂
已经有11人回复
