24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1213  |  回复: 8
当前主题已经存档。

lingchiyu

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】-找脱氢过渡态

用高斯以下命令找碳链脱氢的过渡态
opt=(maxcyc=200,TS,noeigen,calcfc), freq, b3lyp/6-31G** scfcyc=500
但结果总是氢又回到碳上
请高人指点!看该如何解决?


[ Last edited by lingchiyu on 2008-9-16 at 14:19 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

高斯计算反应过渡态

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

spkeey

金虫 (正式写手)

将H 与C 距离拉远,要比想象中的估计Ts较远。让H从比较远的地方慢慢回到TS上。
SPKEEY
2楼2008-09-16 11:30:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lingchiyu

银虫 (小有名气)

谢谢楼上!但是让H从比较远的地方慢慢回到TS上,这样的合理吗?请解释一下其操作合理性。
3楼2008-09-16 14:21:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

spkeey

金虫 (正式写手)

★ ★
jghe(金币+2,VIP+0):谢谢参与讨论,欢迎常来计算版
合理, Ts优化得到的只是势能面上的驻点。 不一定是ts
ts 都需要IRc验证,如果 IRC都证明了是的,就没有问题。

另,你说优化会掉往C方向。说明你优化的点离C-H形成的能量最低点(也是驻点)比过渡态(驻点)近,所以你要稍微拉远点试试。

还有个可能有帮助 calall

[ Last edited by spkeey on 2008-9-16 at 14:58 ]
SPKEEY
4楼2008-09-16 14:43:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lingchiyu

银虫 (小有名气)

真诚的感谢 spkeey  !!!
5楼2008-09-16 21:15:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lingchiyu

银虫 (小有名气)

拉远C-H 键  最后优化得到的-C-H距离为2.576,在-553处有唯一虚频,震动方向就是脱氢的方向,这是过渡态吗?  C-H  距离似乎太远了,已经断键了阿


另,C-H键脱氢虚频位置应该在什么范围内?


[ Last edited by lingchiyu on 2008-9-19 at 09:28 ]
6楼2008-09-19 08:44:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

spkeey

金虫 (正式写手)

C-H键脱氢虚频位置,这个,这个,除非是也作这个工作的,不然谁知道啊?需要经验的东西。
,不好意思了。你应该好好看看这本书:
Exploring Chemistry with Electronic Structure Method
===================================
频率分析的另外一个用处是判断稳定点的本质。稳定点表述的是在势能面上力为零的点,它即可能是极小值,也可能是鞍点。
极小值在势能面的各个方向都是极小的。而鞍点则是在某些方向上是极小的,但在某一个方向上是极大的,因为鞍点是连接两个极小值的点。
在输出文件中可以从两个方面寻找有关鞍点的信息。
        负的频率;
        频率相应简正振动的模式
鞍点存在有负的振动频率,可以定义存在n个负的频率的结构是n阶鞍点。
要注意发现了一个鞍点并不意味着找到了和反应性能等有关的信息。鞍点是连接两个极小值的点,但这两个点不一定是反应物和产物。
当一个结构产生负的振动频率时,可以表明在该振动方向可能存在着能量更低的结构。判断所得鞍点是不是需要的鞍点的方法,就是察看它的简正振动模式,分析是不是可以导向所需要的产物或反应物。
进一步的,更好的办法是通过IRC计算来判断反应物,产物与得到的鞍点是否有关系。将在第八章讨论。

下面列出了需要描述稳定点时必须考虑的问题
目的        虚频数        显示        应该
寻找极小值        0个        是极小值        比较其他异构体,得到最小值
寻找极小值        1个        不是极小值        继续寻找,尝试改变对称性,或按虚频的振动模式修正分子结构
寻找过渡态        0个        是极小值        尝试Opt=QST2或QST3寻找过渡态
寻找过渡态        1个        是过渡态        判断其是否与反应物,产物相关
寻找过渡态        多个        是高阶鞍点,不是连接两点的过渡态        尝试QST2,或者检查虚频对应的振动模式,其中之一可能是指向反应物和产物,在该点的过渡态方向下修正分子,重新计算
SPKEEY
7楼2008-09-19 10:30:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lingchiyu

银虫 (小有名气)

非常感谢spkeey  的热心帮助!
8楼2008-09-19 10:45:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

spkeey

金虫 (正式写手)

如果不相信,就把距离控制在2.576以内,C-H键长以外,
建议1.8 -2.0左右再作个TS优化
SPKEEY
9楼2008-09-19 10:55:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lingchiyu 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求计算机方向调剂 +3 Toffee2 2026-04-16 6/300 2026-04-19 22:37 by ll叶
[考博] 申博自荐 +4 Linxia林夏 2026-04-13 4/200 2026-04-19 19:55 by Equinoxhua
[考研] 289 分105500药学专硕求调剂(找B区学校) +5 白云123456789 2026-04-13 5/250 2026-04-19 18:12 by Equinoxhua
[考研] 304求调剂 +8 castLight 2026-04-16 8/400 2026-04-19 17:14 by 中豫男
[考研] 求调剂推荐 +9 小聂爱学习 2026-04-14 9/450 2026-04-19 17:03 by 中豫男
[考研] 求调剂 +10 小聂爱学习 2026-04-16 12/600 2026-04-19 16:51 by 中豫男
[考研] 291求调剂 +12 关忆北. 2026-04-14 13/650 2026-04-19 16:50 by 中豫男
[考研] 生物学调剂 +10 纸扇zhishan 2026-04-13 10/500 2026-04-18 21:19 by zqndavala
[考研] 297,工科调剂? +5 河南农业大学-能 2026-04-14 5/250 2026-04-18 15:17 by Equinoxhua
[考研] 22408 312求调剂 +24 门路摸摸 2026-04-14 26/1300 2026-04-18 13:04 by wunaiy88
[考研] 收到复试调剂但是去不了 +8 小蜗牛* 2026-04-16 8/400 2026-04-18 11:15 by zixin2025
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[考研] 一志愿华中农业071010,320求调剂 +17 困困困困坤坤 2026-04-14 19/950 2026-04-17 20:08 by 关一盏灯cd
[考研] 一志愿中科大材料与化工,353分还有调剂学校吗 +10 否极泰来2026 2026-04-15 12/600 2026-04-17 17:54 by mapenggao
[考研] 295分求调剂 +5 ?要上岸? 2026-04-17 5/250 2026-04-17 16:51 by fenglj492
[基金申请] RY:中国产出的科学垃圾论文,绝对数量和比例都世界第一 +7 zju2000 2026-04-14 18/900 2026-04-16 11:36 by 欢乐颂叶蓁
[考研] 药学求调剂 +14 喽哈加油 2026-04-14 16/800 2026-04-16 10:15 by beilsong20
[考研] 求调剂学校 +14 不会吃肉 2026-04-13 16/800 2026-04-15 21:59 by noqvsozv
[考研] 各位老师好,求调剂,本科211,一志愿天津大学生物与医药学硕,差两名录取。 +11 路六六jjj 2026-04-13 11/550 2026-04-14 16:01 by zs92450
[考研] 考研调剂 +13 长弓傲 2026-04-13 14/700 2026-04-14 14:44 by zs92450
信息提示
请填处理意见