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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 运行autodock4出错
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hfsongyangsy

铁虫 (初入文坛)

[交流] 运行autodock4出错 已有5人参与

使用ubuntu系统运行到最后一步报错，Analyze ➞ Conformations ➞load后无法打开结果，完全按照说明书上的范例进行的操作，求大神帮忙！

运行autodock4出错
2015-11-18 14:05:05的屏幕截图.png


运行autodock4出错-1
2015-11-18 14:04:39的屏幕截图.png
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1楼 2015-11-18 14:07:12
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这不已经对接成功了吗，重新载入dlg文件，分析结果就好
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2楼2015-11-21 14:32:13
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waltq

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主，我也在学习分子对接，好不容易走到autodock这一步，但是dlg文件又打不开，出现下面的问题，看了半天不知所云。望楼主指点一下。另外，我的系统是32位win7。
IDLE 1.2.2      ==== No Subprocess ====
>>> exception in _buildInputLig
ERROR *********************************************
Traceback (most recent call last):
   File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\ViewerFramework\VF.py", line 898, in tryto
     result = command( *args, **kw )
   File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 3852, in doit
     d.readDlg(dlgFile)
   File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\AutoDockTools\Docking.py", line 105, in readDlg
     self.ch = ConformationHandler(self.ligMol,
AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol'
Exception in Tkinter callback
Traceback (most recent call last):
   File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\lib-tk\Tkinter.py", line 1403, in __call__
     return self.func(*args)
   File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 5482, in guiCallback
     if hasattr(d.ligMol, 'vina_energy'):
AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol'
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waltq
3楼2016-03-04 17:13:23
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王胜1992

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by waltq at 2016-03-04 17:13:23
楼主，我也在学习分子对接，好不容易走到autodock这一步，但是dlg文件又打不开，出现下面的问题，看了半天不知所云。望楼主指点一下。另外，我的系统是32位win7。
IDLE 1.2.2      ==== No Subprocess ====
&am ...

亲，我也遇到了和你同样的问题，请问你解决了嘛？能否指教一下。万分感谢
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4楼2018-11-15 19:58:36
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咖喱牛肉

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主你问题解决了吗，我也遇到这个问题
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但我坦然，欣然。我将大笑，我将歌唱！
5楼2018-11-17 19:44:16
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无知青鸟

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by waltq at 2016-03-04 17:13:23
楼主，我也在学习分子对接，好不容易走到autodock这一步，但是dlg文件又打不开，出现下面的问题，看了半天不知所云。望楼主指点一下。另外，我的系统是32位win7。
IDLE 1.2.2      ==== No Subprocess ====
&am ...

你找到原因了没？
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6楼2019-05-22 21:40:00
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