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xing33

铜虫 (初入文坛)

[求助] 主成分分析的应用步骤问题已有1人参与

做了一组生态实验,但不知如何分析数据,求助!!
具体:测了4个不同地理种群ABCD各30只螨的5种原始体形指标abcde,想比较螨的体形在地理上的变异情况
因体形指标间相关性比较大,所以想先做PCA分析,提取主成分,降维处理(用SPSS)。
但不知是应该:
方案①把各个种群的原始体形指标先平均了,得到Xa,Xb,Xc,Xd,Xe,再对Xa,Xb,Xc,Xd,Xe进行PCA分析,得到4个PC1值(假定只取第一主成分),进行方差分析等。
方案②将各个种群的原始体形指标abcde全部放在一起先进行PCA分析,得到120个PC1值(假定只取第一主成分),再对这120个PC值按种群平均,进行方差分析等。
方案③逐次将每种群的原始体形指标进行PCA分析,得到4*30个PC1值(假定只取第一主成分),将各种群的PC值平均,再进行方差分析等:与②不同的是,③是先将A的abcde数据进行PCA,得到PC1,再建新表将B的abcde数据进行PCA,得到B种群的PC值……
已试验过,每方案得到的PC值都不一样……第一次运用主成分分析……

我也不知道哪种方法才是对的,翻了教材书,也看了好几篇文献,没有讲到这个问题,是我太弱了。。。。求助各位!!谢谢了!!
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当陌路放歌

铜虫 (小有名气)

2楼2015-11-17 23:02:53
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xing33

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 当陌路放歌 at 2015-11-17 23:02:53
你用的什么软件做pca

你好,打算用SPSS的
3楼2015-11-17 23:11:07
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当陌路放歌

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xing33 at 2015-11-17 23:11:07
你好,打算用SPSS的...

spss我没用过 你试试simca_p

发自小木虫IOS客户端
4楼2015-11-17 23:40:52
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xing33

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 当陌路放歌 at 2015-11-17 23:40:52
spss我没用过 你试试simca_p
...

PCA在SPSS的操作步骤我弄的清楚,只是我的原始数据我不知该怎么处理,请详见问题描述,谢谢啊
5楼2015-11-17 23:44:13
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当陌路放歌

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by xing33 at 2015-11-17 23:44:13
PCA在SPSS的操作步骤我弄的清楚,只是我的原始数据我不知该怎么处理,请详见问题描述,谢谢啊...

应该是先降维再pca 具体过程我没深究过因为都是软件生成的 不过先降维比较好

发自小木虫IOS客户端
6楼2015-11-18 00:20:24
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当陌路放歌

铜虫 (小有名气)

如果你的数据数量级差距大 建议先用mapminmax函数归一化处理后再分析可进一步提高数据表达的特征

发自小木虫IOS客户端
7楼2015-11-18 00:22:15
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xing33

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 当陌路放歌 at 2015-11-18 00:22:15
如果你的数据数量级差距大 建议先用mapminmax函数归一化处理后再分析可进一步提高数据表达的特征

已经弄清楚啦,应该数据都放在一起PCA的,十分谢谢你的耐心回复~~~
8楼2015-11-22 17:05:49
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ning_fen

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by xing33 at 2015-11-22 17:05:49
已经弄清楚啦,应该数据都放在一起PCA的,十分谢谢你的耐心回复~~~...

你好,我也在做PCA ,不过刚接触,您能讲下您是怎么解决的么
9楼2015-11-26 14:54:09
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王加菲猫

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我想请问下,在做完PCA分析后,进行方差分析是什么意思呀?我的意思是为什么做方差分析
勇往直前,做自己喜欢的感兴趣的事情,不要碌碌无为
10楼2015-12-13 14:58:27
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