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daisyluna

新虫 (小有名气)

[求助] 结构优化报错已有1人参与

附件有输入文件和输出文件。两噻吩的结构是完全没有问题,可以优化的,可是三噻吩结构就出现如下问题。
已经修改过多次结构了,就是不能解决这个问题。
Small interatomic distances encountered:
     2    1      NaN

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  • 2015-11-16 21:50:00, 11.77 M

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daisyluna

新虫 (小有名气)

不要沉啊
2楼2015-11-17 09:06:33
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
daisyluna: 金币+20, ★★★很有帮助 2015-11-18 09:14:54
daisyluna: 金币+30, ★★★★★最佳答案 2015-11-19 09:11:22
看输出文件是能量产生了振荡导致无法收敛,先换较便宜的方法得出一个收敛的结构,然后再用你的方法读入初始猜去算算看。
同时在计算中去掉geom=connectivity和后面相关的输入部分。
3楼2015-11-17 11:45:17
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daisyluna

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-11-17 11:45:17
看输出文件是能量产生了振荡导致无法收敛,先换较便宜的方法得出一个收敛的结构,然后再用你的方法读入初始猜去算算看。
同时在计算中去掉geom=connectivity和后面相关的输入部分。

你好,按照你的方法改进了,确实能算了,但是频率计算有虚频。能麻烦你帮我再看下吗?

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  • 2015-11-17 18:57:42, 1.13 M
4楼2015-11-17 18:57:44
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daisyluna

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-11-17 11:45:17
看输出文件是能量产生了振荡导致无法收敛,先换较便宜的方法得出一个收敛的结构,然后再用你的方法读入初始猜去算算看。
同时在计算中去掉geom=connectivity和后面相关的输入部分。

你好,虚频只有1.5波数,是不是可以认为稳定构型,这样做可靠吗
5楼2015-11-18 14:26:02
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by daisyluna at 2015-11-17 18:57:44
你好,按照你的方法改进了,确实能算了,但是频率计算有虚频。能麻烦你帮我再看下吗?...

不可以,有虚频即表示结构不是驻点,可将分子想虚频震动方向进行微调后再优化,或用更高精度的基组进行优化
6楼2015-11-18 20:22:19
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