24小时热门版块排行榜    

查看: 743  |  回复: 5

daisyluna

新虫 (小有名气)

[求助] 结构优化报错 已有1人参与

附件有输入文件和输出文件。两噻吩的结构是完全没有问题,可以优化的,可是三噻吩结构就出现如下问题。
已经修改过多次结构了,就是不能解决这个问题。
Small interatomic distances encountered:
     2    1      NaN

非常感谢!
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : TrTETr3-help.zip
  • 2015-11-16 21:50:00, 11.77 M

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

daisyluna

新虫 (小有名气)

不要沉啊
2楼2015-11-17 09:06:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
daisyluna: 金币+20, ★★★很有帮助 2015-11-18 09:14:54
daisyluna: 金币+30, ★★★★★最佳答案 2015-11-19 09:11:22
看输出文件是能量产生了振荡导致无法收敛,先换较便宜的方法得出一个收敛的结构,然后再用你的方法读入初始猜去算算看。
同时在计算中去掉geom=connectivity和后面相关的输入部分。
3楼2015-11-17 11:45:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

daisyluna

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-11-17 11:45:17
看输出文件是能量产生了振荡导致无法收敛,先换较便宜的方法得出一个收敛的结构,然后再用你的方法读入初始猜去算算看。
同时在计算中去掉geom=connectivity和后面相关的输入部分。

你好,按照你的方法改进了,确实能算了,但是频率计算有虚频。能麻烦你帮我再看下吗?

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : -7-help.zip
  • 2015-11-17 18:57:42, 1.13 M
4楼2015-11-17 18:57:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

daisyluna

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-11-17 11:45:17
看输出文件是能量产生了振荡导致无法收敛,先换较便宜的方法得出一个收敛的结构,然后再用你的方法读入初始猜去算算看。
同时在计算中去掉geom=connectivity和后面相关的输入部分。

你好,虚频只有1.5波数,是不是可以认为稳定构型,这样做可靠吗
5楼2015-11-18 14:26:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by daisyluna at 2015-11-17 18:57:44
你好,按照你的方法改进了,确实能算了,但是频率计算有虚频。能麻烦你帮我再看下吗?...

不可以,有虚频即表示结构不是驻点,可将分子想虚频震动方向进行微调后再优化,或用更高精度的基组进行优化
6楼2015-11-18 20:22:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 daisyluna 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 11/550 2026-10-25 12:49 by XiYP04It3Evb
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 10/500 2026-10-25 12:49 by XiYP04It3Evb
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 11/550 2026-10-25 12:45 by XiYP04It3Evb
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 4/200 2026-10-25 12:36 by XiYP04It3Evb
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 4/200 2026-10-25 12:32 by XiYP04It3Evb
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 GVGRDgNfv7P4 2026-10-23 9/450 2026-10-25 12:10 by XiYP04It3Evb
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 GVGRDgNfv7P4 2026-10-23 4/200 2026-10-25 12:10 by XiYP04It3Evb
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 7xHjyB3bAiwg 2026-10-24 3/150 2026-10-25 01:59 by XcOYG53d3x4p
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 7xHjyB3bAiwg 2026-10-24 5/250 2026-10-25 01:33 by XcOYG53d3x4p
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 7xHjyB3bAiwg 2026-10-24 4/200 2026-10-25 01:22 by XcOYG53d3x4p
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 9/450 2026-10-25 00:41 by XcOYG53d3x4p
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 8/400 2026-10-25 00:15 by XcOYG53d3x4p
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 11/550 2026-10-24 23:35 by XcOYG53d3x4p
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 8/400 2026-10-24 22:56 by XcOYG53d3x4p
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 7xHjyB3bAiwg 2026-10-24 3/150 2026-10-24 18:23 by WqtG0Aem8Ufl
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 7xHjyB3bAiwg 2026-10-24 3/150 2026-10-24 15:41 by Equinoxhua
[文学芳草园] 说走就走,走到哪便是哪 +5 Amei_123 2026-10-18 10/500 2026-10-23 22:38 by Amei_123
[文学芳草园] 亲密关系 +7 宋昙 2026-10-21 13/650 2026-10-23 17:07 by 小牧11
[考博] 27秋申博自荐 +4 且听风吟时 2026-10-21 4/200 2026-10-23 13:26 by 大大大肥虫
[考博] 郑州大学申博 +5 stars~ 2026-10-19 8/400 2026-10-22 15:06 by stars~
信息提示
请填处理意见