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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 核酸提取 » 预测该DNA长度在6M左右，那琼脂糖上跑出来的接近20000BP长度的那个条带是什么呢？
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沨1101

金虫 (小有名气)

[求助] 预测该DNA长度在6M左右，那琼脂糖上跑出来的接近20000BP长度的那个条带是什么呢？ 已有4人参与

恕我愚昧，让我说个一直想问的问题。为啥预测DNA长度是在6M左右，而电泳跑出来居然在20000BP长度，这个提出来的到底是什么。我一直想知道。
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1楼 2015-11-16 18:43:33
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1977452216

木虫 (著名写手)

天可汗

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
1楼: Originally posted by 沨1101 at 2015-11-16 18:43:33
恕我愚昧，让我说个一直想问的问题。为啥预测DNA长度是在6M左右，而电泳跑出来居然在20000BP长度，这个提出来的到底是什么。我一直想知道。

请说明一下你做的神马实验

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天道酬勤
2楼2015-11-16 22:39:52
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fuyuandj86

版主 (著名写手)

己所不欲，勿施于人

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰，手有余香，分子生物期待您更多精彩。 2015-11-17 20:47:05
基因组DNA在琼脂胶上就是跑在20kbp左右
不用纠结那个
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The doer of good becomes good, the doer of evil becomes evil.
3楼2015-11-17 03:06:56
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沨1101

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 1977452216 at 2015-11-16 22:39:52
请说明一下你做的神马实验
...

提某植物全基因组。预测大小在6M左右，但是跑出来只有20000，我知道电泳最大跑50000，但是6M是跑不出来的呀。跑出来的是什么

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4楼2015-11-17 19:14:36
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1977452216

木虫 (著名写手)

天可汗

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 沨1101 at 2015-11-17 19:14:36
提某植物全基因组。预测大小在6M左右，但是跑出来只有20000，我知道电泳最大跑50000，但是6M是跑不出来的呀。跑出来的是什么
...

是不是你提出了一些细胞器的dna，然后跑的时候跑出了细胞器dna。

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天道酬勤
5楼2015-11-17 19:23:09
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jackyoung

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰，手有余香，分子生物期待您更多精彩。 2015-11-17 20:47:20
最后大小取决于提取方法和对应操作的剧烈程度，理论值很难实现的。

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CestLaVie
6楼2015-11-17 20:30:50
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xzw1991

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
其实我也在纠结这个问题，可能由于提取的时候的操作会让dna断裂吧，我CTAB提取的，总感觉这么一套提取工序不可能有完整不断的dna，只是断裂的位置不一样而已，但并不影响我们pcr。
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7楼2015-11-17 21:49:12
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沨1101

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by xzw1991 at 2015-11-17 21:49:12
其实我也在纠结这个问题，可能由于提取的时候的操作会让dna断裂吧，我CTAB提取的，总感觉这么一套提取工序不可能有完整不断的dna，只是断裂的位置不一样而已，但并不影响我们pcr。

我也是用的CTAB法提的。本来想让公司提，然后直接测序，结果公司提出来也是20000多一点。我很好奇就自己提了，也是这样。20000多。所以我就想问问大神。

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8楼2015-11-18 17:03:11
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沨1101

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by jackyoung at 2015-11-17 20:30:50
最后大小取决于提取方法和对应操作的剧烈程度，理论值很难实现的。

公司也是提出来在20000左右，我自己提也是20000左右。好纠结,6M是不是全断裂成20000左右了

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9楼2015-11-18 17:06:45
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至繁归于至简

新虫 (正式写手)
胶图什么的好歹来一张啊，具体讲一下

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10楼2015-11-18 17:55:26
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