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shhx2005

银虫 (小有名气)

[交流] 请各位帮忙两个关于测序图的初级问题

1、如果一段基因序列中有点突变存在，比如：ATGCGGTTAACT突变为ATGTGGTTAACT ,那么对于一个个体而言，在这个位点上要么是C要么是T,应该只会有其中的一种情况吧？可是为什么在测序图中会相应位置会出现双峰呢？难道对于一个个体而言，基因组的两个双链的对应位置可以有不匹配的情况吗？本人想来想去实在不能理解这个双峰是如何形成的？可能对于各位大侠，这是一个再简单不过的问题，但对于本人而言去百思不得其解，请知道的路过时给指点一下，不胜感激！1

2、如何得知一段基因序列的3‘端和5’端呢？

3、在基因比对中发现的突变点，如何在genebank中找到该突变点是已知突变点还是未知突变点呢？
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1楼 2008-09-14 19:06:03
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香菱儿

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
司马诸葛(金币+2,VIP+0):谢谢交流 7-13 05:48
第1个问题:
    您是克隆测序还是PCR产物直接测序啊？如果是PCR产物直接测序，
楼上的答案（二倍体,该个体在此位点尚未纯合）就能解释；如果是克隆测序，则主要是测序过程的问题了。

第2个问题：
寻找基因的3‘端，主要找polyA、加尾信号、终止密码；
如何寻找基因的5’端，我也不知道，sorry！
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漫洒英雄泪，相离处士家。谢慈悲剃度在莲台下。没缘法转眼分离乍。赤条条来去无牵挂。那里讨烟蓑雨笠卷单行？一任俺芒鞋破钵随缘化！
3楼2008-09-14 21:38:34
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tsingtao2008

木虫 (著名写手)

地球村村民
★
司马诸葛(金币+1,VIP+0):谢谢交流 7-13 05:49
回答第1个问题:
可能原因: (1)二倍体,该个体在此位点尚未纯合; (2)多倍体起源, 固定杂合性
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钱要流动，人要走动
2楼2008-09-14 21:23:50
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shhx2005

银虫 (小有名气)
多谢一楼和二楼的虫友了，基础课上生化时学的二倍体都就饭吃了，看来还得在温习一下，多谢二位了！

我是pcr直接测序，对于在测序图中出现的这样二倍体双峰，只有在图中找了，1000多个样本，真够受得！没经验啊！！感觉像我们这些搞临床的，做这样的实验简直就是在费钱，实验设计漏洞百出，实验都做完了才知道错了，唉！
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4楼2008-09-15 09:53:43
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