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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 【求助】做过蛋白质同源模建的兄弟姐妹请进来
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yi_63

金虫 (著名写手)

小木虫首席京剧大使

[交流] 【求助】做过蛋白质同源模建的兄弟姐妹请进来

小弟我急需要一个蛋白质的PDB文件，可是查遍了数据库都没有，所以只有自己同源模建了，可是自己对这块完全时一片空白，希望有这方面经验的兄弟姐妹不吝惜你的只言片语，留下你曾经的经验、步骤和用过的软件名称（最好时免费的！），感激不尽！

[ Last edited by yi_63 on 2008-9-14 at 12:10 ]
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在遗忘的日子里我们有自己的回忆曾经痛苦的微笑感伤自己的无奈对代理&合成感兴趣的友友们可以加入群193128997~~
1楼 2008-09-14 09:18:33
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xuzhj01

金虫 (小有名气)
★
gromacs(金币+1,VIP+0):欢迎交流
可以用的有swiss-model  modeller swrl3.0 其网站都有自动模建的服务器 只要提交序列就行，不过精确度需要考虑。 我也想做一些模建，希望可以相互交流。
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5楼2008-09-16 14:12:06
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头头

木虫 (正式写手)
★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
PDB数据库到RCSB里看看  我用的软件可惜是商用的insightII,不过有破解版的,自己可以装上使用,但发文章不可以的
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…spendmoretimewithyourfamilyandfriends……eatyourfavoritefoods……visittheplacesyoulove…
2楼2008-09-14 10:43:32
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yi_63

金虫 (著名写手)

小木虫首席京剧大使
我查了几个知名的PDB数据可，都没有，只好重建了
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在遗忘的日子里我们有自己的回忆曾经痛苦的微笑感伤自己的无奈对代理&合成感兴趣的友友们可以加入群193128997~~
3楼2008-09-14 12:05:48
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weishenme

金虫 (小有名气)
从来没做过找免费的自动模建的服务器吧，有很多的，google一下，看看哪个适合你。
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4楼2008-09-14 12:46:31
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