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huaiyatou2

金虫 (小有名气)

[求助] MS计算过渡态遇到问题求指导 已有1人参与

我在用Dmol计算过渡态时没有勾选proerties 里面的frenquncy 就能很顺利的计算出来,但是用同样的设置再勾选频率算的时候怎么都算不出来,请问该怎么办啊?频率一定要算出来吗?我是新手,求大神指导啊。提示错误是Doml不收敛,设置有问题。
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fffyyy123

银虫 (小有名气)

寻找过渡态的可能结构不用算频率,但要唯一确定过渡态就要找只有一个虚频的结构,就得计算频率。你那错误是电子自恰运算不收敛,建议重新考虑一下反应物和产物的结构是否合理。

发自小木虫Android客户端
7楼2015-11-17 12:13:25
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普通回帖

天命123

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
huaiyatou2: 金币+1, 有帮助 2015-11-13 22:18:19
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-11-22 08:24:00
理论上讲,肯定是要算频率的。过渡态搜索出来后,再算频率。你算中间体的时候能算出频率吗?,中间体频率能算出来的话,过渡态也应该没问题。如果中间提频率算不出,估计就有点费劲了。加油
2楼2015-11-13 16:50:56
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huaiyatou2

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 天命123 at 2015-11-13 16:50:56
理论上讲,肯定是要算频率的。过渡态搜索出来后,再算频率。你算中间体的时候能算出频率吗?,中间体频率能算出来的话,过渡态也应该没问题。如果中间提频率算不出,估计就有点费劲了。加油

我算中间体的时候就算不出频率,然后没设置频率过渡态就跑出来了,现在想回去算频率,还是算不出来,怎么办啊,是不是跑不出频率,就等于过渡态都是错误的?
3楼2015-11-13 17:34:44
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huaiyatou2

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 天命123 at 2015-11-13 16:50:56
理论上讲,肯定是要算频率的。过渡态搜索出来后,再算频率。你算中间体的时候能算出频率吗?,中间体频率能算出来的话,过渡态也应该没问题。如果中间提频率算不出,估计就有点费劲了。加油

我是用doml做的,中间体用初态和末态一连接直接出来了啊,不用算呢
4楼2015-11-13 17:39:27
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天命123

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by huaiyatou2 at 2015-11-13 17:39:27
我是用doml做的,中间体用初态和末态一连接直接出来了啊,不用算呢...

我说的是算频率,中间体频率都算不出,过渡态频率更算不出了。科学的严谨性,肯定需要算频率,中间体不算频率,不能说明是中间体是稳定。
5楼2015-11-14 11:33:27
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huaiyatou2

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 天命123 at 2015-11-14 11:33:27
我说的是算频率,中间体频率都算不出,过渡态频率更算不出了。科学的严谨性,肯定需要算频率,中间体不算频率,不能说明是中间体是稳定。...

哦哦,那找中间体频率的时候一直跳出这个错误怎么办啊Error: SCF iterations not converged in  900 iterations
Message: DMol3 job failed
Error: DMol3 exiting
6楼2015-11-17 09:37:50
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huaiyatou2

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by fffyyy123 at 2015-11-17 12:13:25
寻找过渡态的可能结构不用算频率,但要唯一确定过渡态就要找只有一个虚频的结构,就得计算频率。你那错误是电子自恰运算不收敛,建议重新考虑一下反应物和产物的结构是否合理。
...

你找到我的问题所在了,多谢,我就是在寻找可能结构的时候勾上频率然后算不出来,提示不收敛什么的,不打勾就可以算出可能结构。还是手太生啊,已经在试。
8楼2015-11-17 14:09:02
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wangyf123321

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by huaiyatou2 at 2015-11-17 14:09:02
你找到我的问题所在了,多谢,我就是在寻找可能结构的时候勾上频率然后算不出来,提示不收敛什么的,不打勾就可以算出可能结构。还是手太生啊,已经在试。...

你是怎么操作可以收敛的,我用Dmol算吸附在铁三碳的CO振动频率,计算一直失败,一直提示SCF不收敛
9楼2015-11-17 15:34:18
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huaiyatou2

金虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by wangyf123321 at 2015-11-17 15:34:18
你是怎么操作可以收敛的,我用Dmol算吸附在铁三碳的CO振动频率,计算一直失败,一直提示SCF不收敛...

改动charge max 或者加大步长或者改动smering强制收敛
10楼2015-11-18 09:42:42
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