24小时热门版块排行榜    

查看: 2115  |  回复: 10

huaiyatou2

金虫 (小有名气)

[求助] MS计算过渡态遇到问题求指导 已有1人参与

我在用Dmol计算过渡态时没有勾选proerties 里面的frenquncy 就能很顺利的计算出来,但是用同样的设置再勾选频率算的时候怎么都算不出来,请问该怎么办啊?频率一定要算出来吗?我是新手,求大神指导啊。提示错误是Doml不收敛,设置有问题。
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

fffyyy123

银虫 (小有名气)

寻找过渡态的可能结构不用算频率,但要唯一确定过渡态就要找只有一个虚频的结构,就得计算频率。你那错误是电子自恰运算不收敛,建议重新考虑一下反应物和产物的结构是否合理。

发自小木虫Android客户端
7楼2015-11-17 12:13:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

天命123

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
huaiyatou2: 金币+1, 有帮助 2015-11-13 22:18:19
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-11-22 08:24:00
理论上讲,肯定是要算频率的。过渡态搜索出来后,再算频率。你算中间体的时候能算出频率吗?,中间体频率能算出来的话,过渡态也应该没问题。如果中间提频率算不出,估计就有点费劲了。加油
2楼2015-11-13 16:50:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huaiyatou2

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 天命123 at 2015-11-13 16:50:56
理论上讲,肯定是要算频率的。过渡态搜索出来后,再算频率。你算中间体的时候能算出频率吗?,中间体频率能算出来的话,过渡态也应该没问题。如果中间提频率算不出,估计就有点费劲了。加油

我算中间体的时候就算不出频率,然后没设置频率过渡态就跑出来了,现在想回去算频率,还是算不出来,怎么办啊,是不是跑不出频率,就等于过渡态都是错误的?
3楼2015-11-13 17:34:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huaiyatou2

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 天命123 at 2015-11-13 16:50:56
理论上讲,肯定是要算频率的。过渡态搜索出来后,再算频率。你算中间体的时候能算出频率吗?,中间体频率能算出来的话,过渡态也应该没问题。如果中间提频率算不出,估计就有点费劲了。加油

我是用doml做的,中间体用初态和末态一连接直接出来了啊,不用算呢
4楼2015-11-13 17:39:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

天命123

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by huaiyatou2 at 2015-11-13 17:39:27
我是用doml做的,中间体用初态和末态一连接直接出来了啊,不用算呢...

我说的是算频率,中间体频率都算不出,过渡态频率更算不出了。科学的严谨性,肯定需要算频率,中间体不算频率,不能说明是中间体是稳定。
5楼2015-11-14 11:33:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huaiyatou2

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 天命123 at 2015-11-14 11:33:27
我说的是算频率,中间体频率都算不出,过渡态频率更算不出了。科学的严谨性,肯定需要算频率,中间体不算频率,不能说明是中间体是稳定。...

哦哦,那找中间体频率的时候一直跳出这个错误怎么办啊Error: SCF iterations not converged in  900 iterations
Message: DMol3 job failed
Error: DMol3 exiting
6楼2015-11-17 09:37:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huaiyatou2

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by fffyyy123 at 2015-11-17 12:13:25
寻找过渡态的可能结构不用算频率,但要唯一确定过渡态就要找只有一个虚频的结构,就得计算频率。你那错误是电子自恰运算不收敛,建议重新考虑一下反应物和产物的结构是否合理。
...

你找到我的问题所在了,多谢,我就是在寻找可能结构的时候勾上频率然后算不出来,提示不收敛什么的,不打勾就可以算出可能结构。还是手太生啊,已经在试。
8楼2015-11-17 14:09:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyf123321

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by huaiyatou2 at 2015-11-17 14:09:02
你找到我的问题所在了,多谢,我就是在寻找可能结构的时候勾上频率然后算不出来,提示不收敛什么的,不打勾就可以算出可能结构。还是手太生啊,已经在试。...

你是怎么操作可以收敛的,我用Dmol算吸附在铁三碳的CO振动频率,计算一直失败,一直提示SCF不收敛
9楼2015-11-17 15:34:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huaiyatou2

金虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by wangyf123321 at 2015-11-17 15:34:18
你是怎么操作可以收敛的,我用Dmol算吸附在铁三碳的CO振动频率,计算一直失败,一直提示SCF不收敛...

改动charge max 或者加大步长或者改动smering强制收敛
10楼2015-11-18 09:42:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 huaiyatou2 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 基金中了 +14 laoda193707 2026-08-06 14/700 2026-08-08 00:23 by 实验小白ha
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +9 且听虎啸 2026-08-07 12/600 2026-08-07 21:53 by 理想三旬2025
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +3 布布和一二 2026-08-07 3/150 2026-08-07 15:09 by gltch
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[考博] 【2027博士申请】纳米药物递送方向 20+3 13586093586 2026-08-03 4/200 2026-08-05 09:59 by lfy8008
[基金申请] 有没有H口的?有收到消息的吗? +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 面上提前没消息,有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 18/900 2026-08-04 14:42 by archvillain
[基金申请] 什么时候能放榜呀? +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
请填处理意见