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沉默言慧

木虫 (小有名气)

[求助] HOMO-LOMO

各位大侠，求助
用Gaussian对过渡金属配合物CrNCS进行了结构优化，打开log文件，想查看HOMO-LOMO轨道的能量，如下图
请问哪个是HOMO，哪个是LOMO轨道？
对这张图的内容很不理解啊，还请各位大侠帮忙解惑啊，多谢（另附上log文件）HOMO-LOMO
1.png
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  • 附件 1 : CrNCS4none.log
    • 2015-11-12 10:05:39, 326.52 K

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少说话，多做事
1楼 2015-11-12 10:06:14
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小范范1989

木虫 (著名写手)
我不太懂哈，以下是我的理解：
1：我看了你的问价，你这里面不是毕壳层，能看HOMO和LUMO吗？
2：通过你的输出文件： Alpha virt. eigenvalues --    3.36640   3.36640   3.39045   3.50771   3.50771
Alpha virt. eigenvalues --   25.84431
  Beta  occ. eigenvalues --  -88.54139 -88.54139 -88.54139 -88.54139 -88.54139
  Beta  occ. eigenvalues --  -88.54139 -14.03179 -14.03179 -14.03179 -14.03178
  Beta  occ. eigenvalues --  -14.03178 -14.03175  -9.95338  -9.95338  -9.95333
  Beta  occ. eigenvalues --   -9.95333  -9.95333  -9.95333  -7.61705  -7.61705
  Beta  occ. eigenvalues --   -7.61705  -7.61703  -7.61703  -7.61703  -5.58252
  Beta  occ. eigenvalues --   -5.58252  -5.58252  -5.58252  -5.58251  -5.58251
  Beta  occ. eigenvalues --   -5.57386  -5.57386  -5.57386  -5.57385  -5.57385
  Beta  occ. eigenvalues --   -5.57385  -5.57385  -5.57385  -5.57385  -5.57385
  Beta  occ. eigenvalues --   -5.57385  -5.57385  -2.57788  -1.52068  -1.52068
  Beta  occ. eigenvalues --   -1.52068  -0.60962  -0.60347  -0.60347  -0.60347
  Beta  occ. eigenvalues --   -0.60237  -0.60237  -0.43853  -0.43692  -0.43692
  Beta  occ. eigenvalues --   -0.43692  -0.43685  -0.43685  -0.21446  -0.17021
  Beta  occ. eigenvalues --   -0.17021  -0.16135  -0.16135  -0.16135  -0.12156
  Beta  occ. eigenvalues --   -0.11313  -0.11313  -0.10726  -0.10726  -0.10726
  Beta  occ. eigenvalues --   -0.08413  -0.08413  -0.08413  -0.06419  -0.06419
  Beta  occ. eigenvalues --   -0.06419  -0.06192  -0.06192  -0.06192  -0.05673
  Beta  occ. eigenvalues --   -0.05673  -0.05673   0.04919   0.04919   0.04919
  Beta  occ. eigenvalues --    0.06325   0.06325   0.06325   0.06594   0.06594
  Beta  occ. eigenvalues --    0.06594   0.07159   0.07159   0.07159
  Beta virt. eigenvalues --    0.21710   0.21710   0.21710   0.28340   0.28340
  Beta virt. eigenvalues --    0.29557   0.29557   0.29557   0.33378   0.33378
  Beta virt. eigenvalues --    0.33378   0.34895   0.34895   0.34895   0.35924
这个beta和alpha就是方向，这个occ和virt就是占据和未占据的意思是把？你可以这样看的。
3：个人见解，还请指点
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It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
2楼2015-11-12 20:39:22
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沉默言慧

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 小范范1989 at 2015-11-12 20:39:22
我不太懂哈，以下是我的理解：
1：我看了你的问价，你这里面不是毕壳层，能看HOMO和LUMO吗？
2：通过你的输出文件： Alpha virt. eigenvalues --    3.36640   3.36640   3.39045   3.50771   3.50771
Alpha vi ...

多谢，其实我也不懂，后来在小木虫里搜搜，还是应该看*chk文件，但是我电脑里的GV打开不了*chk文件，更糟糕的是在Linux下，命令formchk不起作用，不知有没有好心人帮忙给转换一下格式
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少说话，多做事
3楼2015-11-13 09:59:52
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小范范1989

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 沉默言慧 at 2015-11-13 09:59:52
多谢，其实我也不懂，后来在小木虫里搜搜，还是应该看*chk文件，但是我电脑里的GV打开不了*chk文件，更糟糕的是在Linux下，命令formchk不起作用，不知有没有好心人帮忙给转换一下格式...

轨道能量，这个log文件就有啊，为什么非要看fchk。看分布的话需要fchk。
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4楼2015-11-13 10:11:58
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沉默言慧

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 小范范1989 at 2015-11-13 10:11:58
轨道能量，这个log文件就有啊，为什么非要看fchk。看分布的话需要fchk。...

因为我想看HOMO和LOMO的轨道，就是您看我图中的那个“Visualize”是灰色的，不可用。小木虫里有人说打开*chk文件，那个“Visualize”就可用了，但是Windows下的GV打不开Linux得到的*chk文件，要在Linux下用命令“formchk *chk *fchk",因为GV能够打开*fchk格式的文件
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少说话，多做事
5楼2015-11-13 10:45:12
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沉默言慧

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 小范范1989 at 2015-11-13 10:11:58
轨道能量，这个log文件就有啊，为什么非要看fchk。看分布的话需要fchk。...

您好，刚刚在小木虫又看了看，看到这句话
”RHF求解时，体系的所用alpha和beta电子数目相等，全部配对，分子轨道双占据，不在区分alpha和beta电子；UHF时，alpha和beta电子分开计算，最高占据轨道有一个或者数个单占据，具体的要看alpha电子的最高占据轨道能量以及beta电子的最高占据能量大小，来区分最高占据轨道具体是alpha还是beta电子所占据的轨道“。
现在貌似有点小明白了，但是我还想问问图上的绿色虚线是什么意思啊？还请大侠指点
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少说话，多做事
6楼2015-11-13 11:12:59
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小范范1989

木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 沉默言慧 at 2015-11-13 11:12:59
您好，刚刚在小木虫又看了看，看到这句话
”RHF求解时，体系的所用alpha和beta电子数目相等，全部配对，分子轨道双占据，不在区分alpha和beta电子；UHF时，alpha和beta电子分开计算，最高占据轨道有一个或者数个单 ...

绿线是0
看分布那就需要fchk了。
为什么lunix的fchk不能用？你需要找到fchk的路径在转。
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It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
7楼2015-11-13 11:39:50
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沉默言慧

木虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 小范范1989 at 2015-11-13 11:39:50
绿线是0
看分布那就需要fchk了。
为什么lunix的fchk不能用？你需要找到fchk的路径在转。...

多谢
不是Linux里的fchk不能用，是chk文件，GV打不开，但能打开fchk，所以要用formchk命令转换格式。刚刚已经转换成功了，那么我的HOMO轨道能量就是97了，那LOMO轨道是98还是95？
HOMO-LOMO-1
3.png
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少说话，多做事
8楼2015-11-13 13:08:36
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