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旭simulation

金虫 (初入文坛)

[求助] 如何进行氢键距离限定

论坛里的大神们,我想问一下在MD模拟中,有一个可以限定氢键距离的方法,从而可以保持蛋白或多肽的二级结构,然后进行前期处理,现在我已经知道了形成氢键的各个原子(配体、受体)如何进行二者对应的距离限定呢(Reorientation and Dimerization of the Membrane-Bound Antimicrobial Peptide PGLa from Microsecond All-Atom MD Simulations 这篇文章中用到这种方法,但是没有具体讲解)?谢谢各位大神,急求结果!!!

如何进行氢键距离限定
Reorientation and Dimerization of the Membrane-Bound Antimicrobial Peptide PGLa from Microsecond All-Atom MD Simulations.png
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