24小时热门版块排行榜    

查看: 6373  |  回复: 3

小讨厌123

新虫 (小有名气)

[求助] lammps中如何求每个原子的总能量 已有1人参与

用lammps模拟pt—ar系统,只想求一下ar的每个原子的平均能量,这个语句和输出文件语句怎么求?谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

相变lammps模拟 QQ475177935 欢迎交流讨论
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alundilong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小讨厌123: 金币+10, 有帮助 2015-11-10 12:32:31
看一下
compute ke/atom 算出动能 http://lammps.sandia.gov/doc/compute_ke_atom.html
compute pe/atom 算出势能 http://lammps.sandia.gov/doc/compute_pe_atom.html
用compute reduce,把两者加起来,就是总能量  http://lammps.sandia.gov/doc/compute_reduce.html
最后再计算出所有ar原子数(用variable中的count函数http://lammps.sandia.gov/doc/variable.html),除一下就好了
2楼2015-11-10 07:00:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小讨厌123

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by alundilong at 2015-11-10 07:00:29
看一下
compute ke/atom 算出动能 http://lammps.sandia.gov/doc/compute_ke_atom.html
compute pe/atom 算出势能 http://lammps.sandia.gov/doc/compute_pe_atom.html
用compute reduce,把两者加起来,就是总能 ...

谢谢你的回答    但是还有些地方不明白
1、计算了ke/atom和pe/atom不就是每个原子的能量吗?直接加起来他们不就是每个原子的能量吗,  为什么还要除ar的原子数呢
2、compute reduce这个命令没有看懂  compute 1 all reduce sum c_ke c_pe这样写对吗  
3、我想输出的是平均能量随时间的变化,可是用fix ave/time有错误提示是fix ave/time compute does  not calculate a scalar
我的程序是这样写的
compute ar_pe ar pe/atom     #直接计算Ar中每个原子的动能和势能
compute ar_ke ar ke/atom
compute ar_total ar reduce sum c_ar_ke c_ar_pe   # 这样是不是将动能和势能的值加起来了
fix 1  all ave/time 1 1000 1000 c_ar_total file info.data  #输出每一时刻的平均能量
可是这样写有错误 fix ave/time compute does  not calculate a scalar   您能帮我改一下吗  看哪里有问题  ,该怎么改,我就是想要能量随时间的变化  谢谢
相变lammps模拟 QQ475177935 欢迎交流讨论
3楼2015-11-10 13:01:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

uy_naiT

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 小讨厌123 at 2015-11-10 13:01:30
谢谢你的回答    但是还有些地方不明白
1、计算了ke/atom和pe/atom不就是每个原子的能量吗?直接加起来他们不就是每个原子的能量吗,  为什么还要除ar的原子数呢
2、compute reduce这个命令没有看懂  compute 1 ...

不知楼主这个问题解决没有?想请教一下
4楼2018-03-21 16:12:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 小讨厌123 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +7 Auroracx 2026-03-22 7/350 2026-03-22 12:38 by 素颜倾城1988
[考研] 求调剂一志愿海大,0703化学学硕304分,有大创项目,四级已过 +3 幸运哩哩 2026-03-22 5/250 2026-03-22 11:01 by 杨杨杨紫
[考博] 招收博士1-2人 +3 QGZDSYS 2026-03-18 4/200 2026-03-22 10:25 by QGZDSYS
[基金申请] 山东省面上项目限额评审 +4 石瑞0426 2026-03-19 4/200 2026-03-22 08:50 by Wei_ren
[考研] 资源与环境 调剂申请(333分) +5 holy J 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:42 by Catalysis25
[考研] 考研调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-21 3/150 2026-03-21 20:04 by 无际的草原
[考研] 297求调剂 +3 喜欢还是不甘心 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:33 by 学员8dgXkO
[考研] 266求调剂 +3 哇呼哼呼哼 2026-03-20 3/150 2026-03-21 16:46 by barlinike
[考研] 346求调剂[0856] +4 WayneLim327 2026-03-16 7/350 2026-03-21 04:02 by JourneyLucky
[考研] 材料学求调剂 +4 Stella_Yao 2026-03-20 4/200 2026-03-20 20:28 by ms629
[考研] 08工学调剂 +5 用户573181 2026-03-20 5/250 2026-03-20 15:47 by xia_2003
[考研] 298-一志愿中国农业大学-求调剂 +9 手机用户 2026-03-17 9/450 2026-03-20 14:24 by 无懈可击111
[考研] 材料学硕318求调剂 +5 February_Feb 2026-03-19 5/250 2026-03-19 23:51 by 23Postgrad
[考研] 328求调剂,英语六级551,有科研经历 +4 生物工程调剂 2026-03-16 12/600 2026-03-19 11:10 by 生物工程调剂
[考研] 【同济软件】软件(085405)考研求调剂 +3 2026eternal 2026-03-18 3/150 2026-03-18 19:09 by 搏击518
[考研] 290求调剂 +3 p asserby. 2026-03-15 4/200 2026-03-17 16:35 by wangkm
[考研] 有没有道铁/土木的想调剂南林,给自己招师弟中~ +3 TqlXswl 2026-03-16 7/350 2026-03-17 15:23 by TqlXswl
[考研] 一志愿,福州大学材料专硕339分求调剂 +3 木子momo青争 2026-03-15 3/150 2026-03-17 07:52 by laoshidan
[考研] 11408 一志愿西电,277分求调剂 +3 zhouzhen654 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:03 by laoshidan
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
信息提示
请填处理意见