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小讨厌123新虫 (小有名气)
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lammps中如何求每个原子的总能量 已有1人参与
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| 用lammps模拟pt—ar系统，只想求一下ar的每个原子的平均能量，这个语句和输出文件语句怎么求？谢谢 |
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alundilong
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【答案】应助回帖
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小讨厌123: 金币+10, ★有帮助 2015-11-10 12:32:31
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小讨厌123: 金币+10, ★有帮助 2015-11-10 12:32:31
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看一下 compute ke/atom 算出动能 http://lammps.sandia.gov/doc/compute_ke_atom.html compute pe/atom 算出势能 http://lammps.sandia.gov/doc/compute_pe_atom.html 用compute reduce，把两者加起来，就是总能量 http://lammps.sandia.gov/doc/compute_reduce.html 最后再计算出所有ar原子数(用variable中的count函数http://lammps.sandia.gov/doc/variable.html)，除一下就好了 |
2楼2015-11-10 07:00:29
小讨厌123
新虫 (小有名气)
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谢谢你的回答 但是还有些地方不明白 1、计算了ke/atom和pe/atom不就是每个原子的能量吗？直接加起来他们不就是每个原子的能量吗， 为什么还要除ar的原子数呢 2、compute reduce这个命令没有看懂 compute 1 all reduce sum c_ke c_pe这样写对吗 3、我想输出的是平均能量随时间的变化，可是用fix ave/time有错误提示是fix ave/time compute does not calculate a scalar 我的程序是这样写的 compute ar_pe ar pe/atom #直接计算Ar中每个原子的动能和势能 compute ar_ke ar ke/atom compute ar_total ar reduce sum c_ar_ke c_ar_pe # 这样是不是将动能和势能的值加起来了 fix 1 all ave/time 1 1000 1000 c_ar_total file info.data #输出每一时刻的平均能量 可是这样写有错误 fix ave/time compute does not calculate a scalar 您能帮我改一下吗 看哪里有问题 ，该怎么改，我就是想要能量随时间的变化 谢谢 |
3楼2015-11-10 13:01:30
uy_naiT
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4楼2018-03-21 16:12:02