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8913813

铜虫 (初入文坛)

[求助] 优化后chk和log文件的结构键不一样 已有2人参与

刚接触高斯不久,优化了一个分子,结束后我发现CHK和LOG里面优化后的分子成键不太一样,我要用哪一个呢?优化后chk和log文件的结构键不一样
NaAB_log.jpg


优化后chk和log文件的结构键不一样-1
NaAB_chk.jpg
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  • 附件 1 : na-ab-o-f.chk
  • 2015-11-09 21:03:54, 1.3 M
  • 附件 2 : NA-AB-O-F.LOG
  • 2015-11-09 21:03:54, 75.29 K
  • 附件 3 : Na-ab-o-f.gjf
  • 2015-11-09 21:05:22, 720 bytes

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lgc020305

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
8913813: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2015-11-11 18:54:53
1. 正常计算结束的.chk和.log文件给出的结构应该是一样的(最后一步)。
2. 你的两个图感觉就是一个相同结构,只是成键不一样。
这里涉及到一个关于“化学键”的概念。常见的视图软件只会根据两个原子之间的距离判断成键情况,如果设置2Å是单键,1Å是双键,那么1.4Å, 1.7Å都会给你显示位1.5倍健。
3. 你需要把这两个结构重叠一下,应该是一样的原子位置。
3楼2015-11-10 08:33:19
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婴罂123

禁虫 (初入文坛)

感谢参与,应助指数 +1
本帖内容被屏蔽

2楼2015-11-09 21:28:54
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