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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » Ewald summation求助
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混乱的流动

银虫 (小有名气)

[求助] Ewald summation求助 已有1人参与

请问谁有Ewald summation 的程序段，我想用一下。实现以下目的：在三维计算区域内有1000个球体，带电量为q，其中y-z方向是周期性边界条件，x方向没有周期性。用Ewald 应该能算出库伦静电作用势或者静电作用力吧？
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1楼 2015-11-09 14:44:16
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
如果使用lammps，可以使用kspace_modify slab这个命令，详细说明参见
http://lammps.sandia.gov/doc/kspace_modify.html

不过说明一下，Ewald summation适用的是电中性体系，如果你的体系非中性，贸然使用Ewald summation会带来误差，而且体系总电荷距离0越远，误差越大。
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2楼2015-11-09 16:09:41
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混乱的流动

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lsloneil at 2015-11-09 16:09:41
如果使用lammps，可以使用kspace_modify slab这个命令，详细说明参见
http://lammps.sandia.gov/doc/kspace_modify.html

不过说明一下，Ewald summation适用的是电中性体系，如果你的体系非中性，贸然使用Ewald ...

也就是正负电荷量差不多才行？为什么有这样的特性？

发自小木虫IOS客户端
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3楼2015-11-09 20:02:28
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 混乱的流动 at 2015-11-09 00:02:28
也就是正负电荷量差不多才行？为什么有这样的特性？
...

是的。因为如果总电荷不为0的话，Ewald summation在k空间求和那一部分的级数会发散。通常为了避免这种问题，分子模拟的程序在处理非电中性系统的Ewald summation是都会给系统加上一个均匀分布的背景电荷密度来中和这部分电荷。如果你的体系净电荷不大（比如说只有-2 e），那么这个背景电荷的影响是比较小的，反之，如果你的体系净电荷很大，那么Ewald summation带来的误差就会很大。
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4楼2015-11-09 23:24:06
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chuntao118

新虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lsloneil at 2015-11-09 16:09:41
如果使用lammps，可以使用kspace_modify slab这个命令，详细说明参见
http://lammps.sandia.gov/doc/kspace_modify.html

不过说明一下，Ewald summation适用的是电中性体系，如果你的体系非中性，贸然使用Ewald ...

如果是谁分子体系的话需要注意些什么？在这里你说的体系是非中性指的是分子本身？还是系统本身是中性、系统的分子可以是极性分子（比如：水分子体系）？
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5楼2015-11-10 08:26:32
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by chuntao118 at 2015-11-09 12:26:32
如果是谁分子体系的话需要注意些什么？在这里你说的体系是非中性指的是分子本身？还是系统本身是中性、系统的分子可以是极性分子（比如：水分子体系）？...

系统必须是中性，分子可以不是中性，只要系统总电荷为0就行。
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6楼2015-11-10 09:26:52
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