【答案】应助回帖

9楼: Originally posted by Am Melody at 2015-11-15 20:45:38
您好，我的体型相对复杂，主要是想算不同表面不同终端的表面能，如果我建的模型上下终端不对称，怎么考虑呢？算表面能的，用固定中间弛豫两边的模型一定要对称或反对称吗？...

8楼: Originally posted by Am Melody at 2015-11-15 20:42:41
您好，我主要是要算表面能，①这个单边的模型算表面能怎么算，还有这种模型需要注意什么问题吗？
②如果我用弛豫两边的那种模型，上下表面不对称可以吗？是否不对称的模型加上偶极矩矫正参数还是可以算表面能的？...

11楼: Originally posted by 我爱天津 at 2015-11-15 22:34:45
对称才行
反对称算的是cleavage能
而不是表面能 表面能得对称才行
...

12楼: Originally posted by jpchou at 2015-11-16 05:39:13
①这个单边的模型算表面能怎么算，还有这种模型需要注意什么问题吗？
> 簡單的說，若你的系統若只有一種元素(X)，那表面能計算只要算兩個能量
       1. total energy of X surface system:  E(tot)
        ...

14楼: Originally posted by Am Melody at 2015-11-16 08:05:45
哈哈，谢谢你的回复，我主要是算表面能，只是体系比较复杂，有四种原子，很难找到对称的模型，所以想确定这点...

15楼: Originally posted by jpchou at 2015-11-16 16:22:10
只要能做出單邊模型
要做上下對稱模型就不是件難事
1. 做出單邊模型
2. 複製
3. 將複製的原子之 z 座標乘上 -1  (產生 mirror symmetry)
4. 跟據表面模型之週期性對複製後的原子適當地做 xy 方向平移
完成...

16楼: Originally posted by Am Melody at 2015-11-16 20:41:59
可以这样手动建吗，我用ms建的模，一直以为只能通过调节shickness和top这两个值来获取表面模型。。。按您说的这样子手动处理，会不会不符合体系本身的情况？...

17楼: Originally posted by jpchou at 2015-11-16 22:08:49
可以这样手动建吗，我用ms建的模，一直以为只能通过调节shickness和top这两个值来获取表面模型。。。
> 我不會用 MS 耶...哈

按您说的这样子手动处理，会不会不符合体系本身的情况？
> 所以要小心處理我 ...