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qaz199018金虫 (小有名气)
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Genbank登录号前两位英文字母代表什么？ 已有1人参与
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| 在Genbank搜索某物种的序列，有些貌似是重复的，提交者、物种、发表的期刊信息什么的都一样，具体序列是否一样没仔细看（看着眼花），但是登录号不一样，有NC_开头的，还有什么JQ,KR开头的。。。那我在统计时能把这两条算作一条吗，能的话应该用哪条呢？NC_开头的吗？谢谢大神！！ |
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qaz199018
金虫 (小有名气)
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7楼2015-11-09 15:25:59
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21091/ 最早登陆号是一个字母加5个数字，后来不够用，变成现在的2个字母加6个数字。但是提交的大量序列中有很多冗余序列，为了减小冗余，NCBI就通过利用计算机算法把一致的序列归并在一起，这些人工生成的序列都是用类似NP_xxxxx的格式编码，严格的编码规则是[ANXYZ][CPGMPRTWZS]_([A-Z]{1,4})[0-9]{1,9}。每种的特定含义见链接中的 Table I |
3楼2015-11-08 23:15:43
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http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21091/ 最早登陆号是一个字母加5个数字，后来不够用，变成现在的2个字母加6个数字。但是提交的大量序列中有很多冗余序列，为了减小冗余，NCBI就通过利用计算机算法把一致的序列归并在一起，这些人工生成的序列都是用类似NP_xxxxx的格式编码，严格的编码规则是[ANXYZ][CPGMPRTWZS]_([A-Z]{1,4})[0-9]{1,9}。每种的特定含义见链接中的 Table I。也就是说你查到的其实是同一条序列，一个登陆号是最早提交时生成的，NC的是计算机二次注释时生成的。 |
4楼2015-11-08 23:17:31
qaz199018
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5楼2015-11-08 23:27:06
