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suiminghang

金虫 (初入文坛)

[求助] 跪求关于锌指蛋白的PDB结构!! 已有1人参与

想求得三个到五个锌指蛋白四配位的结构,有两种类型,一组是锌和三个组氨酸和一个半胱氨酸配位、还有一组是锌和四个组氨酸配位的。
感激不尽,在PDB数据库中实在不知道用什么方法能找到了~
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希望大家多多帮忙,我也会尽我所能!
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屁桃粉

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

先查找相应的文献找到符合你要的锌指蛋白,再在文献中看你所要的锌指蛋白是什么来源的是否有晶体结构解析出来才好在pdb上搜。不然你这么盲目是搜不到的
2楼2015-11-10 09:59:32
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王饭饭_

新虫 (初入文坛)

我的做法是直接在PDB官网的搜索框输入:ZFP,或者输入:ZN。
因为蛋白质数据库本身就是蛋白质的一个综合,输入特殊的成分就能找到包含它的蛋白质,具体使用哪种锌指蛋白可以自行决定,如果没有确定的指示,默认使用第一个。
Unique Ligands        ZN
别灰心,困难总比办法多。。。
3楼2023-07-04 09:15:25
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