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zxc252487892

铜虫 (小有名气)

[交流] 使用msi2lmp获得data文件出错是怎么回事? 已有5人参与

问题应该出在力场的设置上或者模型本身的问题。
下图锥体是金刚石,长方体是氮化硅,是利用纳米团簇建立的。
力场我加了pcff力场在type里我找不到正在适合c,n,si的类型,所以都选了第一个,
是我选错了还是本身就不能利用ms建模?

另外听说可以直接利用lammps的tools中的Moltemplate建模,我还没看manual,实现起来困难吗?

使用msi2lmp获得data文件出错是怎么回事?
使用msi2lmp获得data文件出错是怎么回事?-1

错误信息:
$ msi2lmp.exe SiN -class 2 -frc pcff > data.SiN
WARNING inconsistent # of connects on atom 1 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 3 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 4 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 7 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 8 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 9 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 10 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 12 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 17 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 19 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 20 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 21 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 24 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 25 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 26 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 28 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 31 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 33 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 35 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 38 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 40 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 42 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 44 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 47 type xx
WARNING inconsistent # of connects on atom 51 type xx
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zxc252487892

铜虫 (小有名气)

来,我再顶一下
2楼2015-11-10 10:19:23
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1195222016

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
同错误,不能打开力场
3楼2015-11-16 14:58:02
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zxc252487892

铜虫 (小有名气)

求关注,求关注啊
4楼2015-11-20 11:43:46
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sunyiqiang09

金虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
lammps里支持的力场为pcff和cvff,这两种力场支持的原子类型有限,所以有限原子无法算出,但是如果用universal通用力场算,ms算出来后,lammps没有支持这种力场,也转换不出data文件

发自小木虫Android客户端
5楼2015-11-20 14:02:38
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zxc252487892

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by sunyiqiang09 at 2015-11-20 14:02:38
lammps里支持的力场为pcff和cvff,这两种力场支持的原子类型有限,所以有限原子无法算出,但是如果用universal通用力场算,ms算出来后,lammps没有支持这种力场,也转换不出data文件
...

难度意味着用ms建模的思路行不通吗?
我的模型可以通过其他方法转换为data文件吗?
6楼2015-11-21 10:24:46
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ericmuse

铜虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by zxc252487892 at 2015-11-21 10:24:46
难度意味着用ms建模的思路行不通吗?
我的模型可以通过其他方法转换为data文件吗?...

楼主解决这个问题了吗?我现在遇到的情况和你一模一样。。
7楼2017-03-09 10:53:14
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刺猬5854

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
表示遇到了相同的问题,但是力场没问题

发自小木虫Android客户端
8楼2017-05-21 09:46:32
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luckied

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
您好,请教您的问题解决了吗?我也遇到了相同的问题

发自小木虫IOS客户端
9楼2019-03-13 14:59:05
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