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linlinyu9898

新虫 (小有名气)

[求助] pdb文件里找结合位点 已有1人参与

在PDB数据库里下载了一个蛋白质-RNA复合物的文件2DR5，想寻找蛋白质-RNA的具体结合残基，请问用写字板打开后能找到么？怎么样才可以找到已知复合物的结合位点？万分感谢！！
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  • 附件 1 : 2DR5.pdb
    • 2015-11-05 12:58:39, 386.73 K

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1楼 2015-11-05 12:59:26
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windf1ower

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

请用pymol……
右侧ASHLC几个字母，点A--present--ligand sites--cartoon
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

linlinyu9898
问题咨询请邮件联系zhouqing_gzu@sina.com
2楼2015-11-09 11:04:21
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linlinyu9898

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by windf1ower at 2015-11-09 11:04:21
请用pymol……
右侧ASHLC几个字母，点A--present--ligand sites--cartoon

谢谢你。但是看不到相应的结合部位的具体残基啊，比如说能不能显示出是20种氨基酸的哪几种，Asn?Glu?等等。怎样才能知道具体的呢？
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3楼2015-11-09 13:47:50
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