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上官爵

新虫 (初入文坛)

[求助] 底物与酶之间的距离测定 已有1人参与

各位前辈大家好,在下刚涉及到分子模拟领域,请问大家做分子模拟时,底物与酶催化中心的距离测定怎样测出来吗,底物怎样建模,底物与酶怎样对接,推荐一下比较好的模拟软件。求大神指教,不胜感激。
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blacksep

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用autodock吧,底物用chem3d生成,我最近刚开始研究这个。
2楼2015-11-04 21:00:26
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qyj2006

铁杆木虫 (小有名气)

明明白白我的心,寻找一份真感情!
3楼2015-11-05 05:41:58
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)


为什么要测定底物与酶之间的距离呢?如果要测定的话,可以用pymol测定两个分子之间的距离,Modeller进行同源建模,autodock进行分子对接
4楼2015-11-06 08:44:43
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