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xtmgah31

银虫 (小有名气)

[交流] 降落PCR

降落pcr结束后,用PCR产物在进行几个循环的扩增是做什么用的呢?
94 ℃预变性 5min ; 第1、 2 循环 94 ℃变性 1 min ,64℃退火 1 min ,
72 ℃延伸 2 min ; 其后的 18 个循环 ,退火温度每 2个循环降低 1 ℃,其他条件不变; 最后 15 个循环退火温度为55 ℃,其他条件不变; 72℃延伸 10 min。
PCR产物经过一次扩增 (95 ℃0.5 min , 50℃0.5 min , 72℃1 min ,循环 3 次; 72 ℃延伸 10 min)
后 ,用 PCR产物纯化试剂盒(申能博彩)纯化
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tangtl

木虫 (正式写手)

小木虫潜水者

我用过降落pcr 用来退火人工合成的基因
那你这样逐步递减1度的不知道用来做什么
2楼2008-09-10 19:50:43
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xtmgah31

银虫 (小有名气)

我也不明白,所以拿来讨论讨论。扩增完了以后PCR产物还要再循环几次,也不知道是怎么回事
3楼2008-09-10 20:24:44
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peng5053

银虫 (正式写手)

Dr.

★ ★
sxdxrhyy(金币+2,VIP+0):鼓励!欢迎常来!
其实是很简单的,所谓降落PCR就是逐步降低退火温度,从而寻找一个最合适的退火温度,简单的说吧,在做PCR的时候只有在合适的退火温度下,引物与模板才能够有效地配对,此时的扩增是以指数的形式增长,当不能很好的配对的时候就是倍数的形式增长。是指每隔一个循环降低1°C反应退火温度,直至达到“Touchdown”
退火温度,然后以此退火温度进行10个左右的循环。该方法最初出
现是为了避开确定最佳退火温度而进行的复杂的反应优化过程。正
确和非正确退火温度之间的任何差异将造成每个循环PCR产物量的两
倍差异(每摄氏度造成4倍差异)。因此相对于非正确产物,正确的
产物可以得到富集。该方法的另一个应用是在确定已知序列肽的DNA序列。
具体过程如下:使用两套与已知序列肽两末端可能配对的简并引物,
这只需要知道一段长为13个氨基酸的肽段序列,5’和3’引物各
长18个碱基(6个氨基酸),两者之间有一个碱基以上的间隔。
使用简并引物即可以进行“TouchdownPCR”。

我曾经试过,效果还是很好的!可能写的不清楚,你们刻以看看相关的文献
多点思维,多点idea
4楼2008-09-13 02:50:15
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