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石成金

新虫 (初入文坛)

[求助] 各位大神,我要求助关于手写poscar的问题。。。。 已有2人参与

本人新手一个,刚接触vasp计算,在学习手写poscar。
老师给我布置了一个作业,让我写64个C原子中替代一个N原子的poscar,就是写63个C一个N,一点思路都没有,求大神相助!
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LJ云水禅心

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-10-27 08:01:33
石成金: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢! 2015-10-27 14:35:17
楼主说的太不清楚了,你先确定64个原子的C结构,就可以得到这个C的POSCAR,然后将某个位置上的C手动改成N就可以了,不知道我理解对你的意思了没
2楼2015-10-26 17:43:31
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石成金

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by LJ云水禅心 at 2015-10-26 17:43:31
楼主说的太不清楚了,你先确定64个原子的C结构,就可以得到这个C的POSCAR,然后将某个位置上的C手动改成N就可以了,不知道我理解对你的意思了没

如果是金刚石的结构,怎么确定的写出64个C的坐标啊?
3楼2015-10-26 21:00:06
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LJ云水禅心

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 石成金 at 2015-10-26 21:00:06
如果是金刚石的结构,怎么确定的写出64个C的坐标啊?...

金刚石结构建2*2*2的超胞刚好64个原子,然后将你想要取代的那个原子换成N即可
4楼2015-10-26 21:19:48
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石成金

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by LJ云水禅心 at 2015-10-26 21:19:48
金刚石结构建2*2*2的超胞刚好64个原子,然后将你想要取代的那个原子换成N即可...

大神这个是我写的金刚石的poscar,导入vesta扩成2*2*2的晶胞,为什么是95个原子?
3D\Atomistic
1.0
        3.5659999847         0.0000000000         0.0000000000
        0.0000000000         3.5659999847         0.0000000000
        0.0000000000         0.0000000000         3.5659999847
    C
    8
Direct
     0.000000000         0.000000000         0.000000000
     0.000000000         0.500000000         0.500000000
     0.500000000         0.500000000         0.000000000
     0.500000000         0.000000000         0.500000000
     0.750000000         0.250000000         0.750000000
     0.250000000         0.250000000         0.250000000
     0.250000000         0.750000000         0.750000000
     0.750000000         0.750000000         0.250000000
5楼2015-10-26 22:22:12
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不取俗名

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-11-23 08:15:59
用ms建模,然后export为cif格式,用vesta打开,export为poscar格式,希望能帮到您

发自小木虫Android客户端
6楼2015-10-27 08:23:30
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LJ云水禅心

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 石成金 at 2015-10-26 22:22:12
大神这个是我写的金刚石的poscar,导入vesta扩成2*2*2的晶胞,为什么是95个原子?
3D\Atomistic
1.0
        3.5659999847         0.0000000000         0.0000000000
        0.0000000000         3.565999 ...

在MS里面直接扩胞,然后将原子替换成N之后export出cif文件,拖入VESTA再输出POSCAR
7楼2015-10-27 08:56:35
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石成金

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 不取俗名 at 2015-10-27 08:23:30
用ms建模,然后export为cif格式,用vesta打开,export为poscar格式,希望能帮到您

谢谢!
8楼2015-10-27 14:32:15
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石成金

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by LJ云水禅心 at 2015-10-27 08:56:35
在MS里面直接扩胞,然后将原子替换成N之后export出cif文件,拖入VESTA再输出POSCAR...

谢谢大神,我已明白,因为有共用的原子所以看起来是95个,实际上是64个!
9楼2015-10-27 14:34:42
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不取俗名

木虫 (正式写手)

对的,多少个原子要看poscar里有多少个

发自小木虫Android客户端
10楼2015-10-27 15:03:02
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