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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】如何对坐标进行＂冻结操作＂谢谢！
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chenyidan

[交流] 【求助】如何对坐标进行＂冻结操作＂谢谢！

请教大家，如何对一晶体结构，在高斯中进行＂冻结操作＂啊？　
如果有这方的资料总结，或是相关文献希望能多多指教，谢谢！

[ Last edited by zzgyb on 2008-9-10 at 11:48 ]
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1楼 2008-09-08 22:08:44
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xiekf1985

木虫 (正式写手)
★ ★
gromacs(金币+2,VIP+0):谢谢解答
GAussian说明中有，把参数分为Constant和Variable两部分，Constant部分参数被冻结
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2楼2008-09-09 13:09:16
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sandycug

金虫 (小有名气)
★ ★
gromacs(金币+2,VIP+0):谢谢解答
直接把相应的院子序号在坐标后列表
比如将10号原子冻结

10 F
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3楼2008-09-09 13:13:11
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kylin78

金虫 (小有名气)
3楼的说的不是gaussian 里的用法吧
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4楼2008-09-09 17:16:25
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sandycug

金虫 (小有名气)
是gaussian的做法
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5楼2008-09-09 20:55:11
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hbnuwangshuling

铜虫 (小有名气)

加F，文件为什么没冻结？

我的输入是# RHF/6-31G  OPT

frozen 1  2

0 1
C        -14.284202000      -0.482006000       0.000000000
C        -13.006781000       0.330542000       0.000000000
C        -11.687822000      -0.273042000       0.000000000
C        -10.528298000       0.395763000       0.000000000
C         -9.223995000      -0.240691000       0.000000000
C         -8.053933000       0.409834000       0.000000000
C         -6.757951000      -0.243110000       0.000000000
C         -5.582374000       0.397316000       0.000000000
C         -4.291199000      -0.265011000       0.000000000
C         -3.112568000       0.369648000       0.000000000
C         -1.823934000      -0.297610000       0.000000000
C         -0.643918000       0.334402000       0.000000000
C          0.643918000      -0.334402000       0.000000000
C          1.823934000       0.297610000       0.000000000
C          3.112568000      -0.369648000       0.000000000
C          4.291199000       0.265011000       0.000000000
C          5.582374000      -0.397316000       0.000000000
C          6.757951000       0.243110000       0.000000000
C          8.053933000      -0.409834000       0.000000000
C          9.223995000       0.240691000       0.000000000
C         10.528298000      -0.395763000       0.000000000
C         11.687822000       0.273042000       0.000000000
C         13.006781000      -0.330542000       0.000000000
C         14.135655000       0.387518000       0.000000000
H        -15.043347000      -0.035115000       0.000000000
H         15.043347000       0.035115000       0.000000000
H        -14.084629000      -1.461196000       0.000000000
H        -13.060329000       1.405870000       0.000000000
H        -11.658248000      -1.351765000       0.000000000
H        -10.541126000       1.472819000       0.000000000
H         -9.218259000      -1.319030000       0.000000000
H         -8.051725000       1.487135000       0.000000000
H         -6.764352000      -1.321038000       0.000000000
H         -5.571629000       1.474636000       0.000000000
H         -4.304395000      -1.342665000       0.000000000
H         -3.097131000       1.446976000       0.000000000
H         -1.840508000      -1.375086000       0.000000000
H         -0.626647000       1.411773000       0.000000000
H          0.626647000      -1.411773000       0.000000000
H          1.840508000       1.375086000       0.000000000
H          3.097131000      -1.446976000       0.000000000
H          4.304395000       1.342665000       0.000000000
H          5.571629000      -1.474636000       0.000000000
H          6.764352000       1.321038000       0.000000000
H          8.051725000      -1.487135000       0.000000000
H          9.218259000       1.319030000       0.000000000
H         10.541126000      -1.472819000       0.000000000
H         11.658248000       1.351765000       0.000000000
H         13.060329000      -1.405870000       0.000000000
H         14.084629000       1.461196000       0.000000000

1 2 F
运行结果没有冻结1 ，2原子它们之间的键长变化了，这是为什么？哪里出错了呢？
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6楼2008-09-10 10:32:33
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mscic

金虫 (正式写手)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
1，2 后面要写键参数吧？然后加个F表示冻结，还有S可是扫描等等。。。GAUSSIAN自带例子中有这个的
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7楼2008-09-10 10:43:00
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布丁3835

金虫 (小有名气)
★
jghe(金币+1,VIP+0):谢谢你参与讨论！
在分子描述部分使用直角坐标，在元素符号与坐标之间有0表示自由优化，-1表示冻结。
比如
C   0   x   y   z
C    -1 x  y   z
N   -1  x  y   z
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8楼2008-10-05 15:17:52
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)
★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
看看下面的文章就知道了：
http://new.quantumchemistry.net/ ... ew/200602/1021.html
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9楼2008-10-05 19:55:19
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mscic

金虫 (正式写手)
★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
在ROUTE SECTION里面的关键词加一个MODREDUNDANT
然后在分子结构后面单独列出需要冻结的原子编号,加个F就可以.在GAUSSIAN的OPT关键字中有介绍.
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10楼2008-10-07 09:17:34
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