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代谢组学待鉴定化合物信号和标样不同的问题
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| 我作代谢组学，用LC-MS测试一个生物样品（人体呼吸冷凝液）,仪器是waters ESI-QTOF，负电模式。有一个我比较感兴趣的未知化合物通过查database有几个可能，质量和分子式都很匹配实验数据，但是买来这几个标样用同样的方法测试，它们在柱子上的保留时间都和我的未知化合物相似，但发现它们的母离子[M-H]-都是在12V椎孔电压下比30V椎孔电压要信号要高很多。但是在人体呼吸冷凝液中那个化合物的母离子却是在12V椎孔电压比30V椎孔电压信号要低一些，请问这是为什么呢？是不是此种代谢物在生物样品的matrix里面也许表现会和单纯的标样有所不同呢，还是根本就不是我买的那些标样？ |
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jjf139
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估计基质可能有干扰，导致前后锥孔电压可能有差异。也有可能化合物结构不对，后者可能性较大。 发自小木虫Android客户端 |
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