| 查看: 2667 | 回复: 8 | ||||
tuhao2004木虫 (正式写手)
|
[交流]
聊一聊MS中几个DFT模块的优势和缺陷？
|
|
以下是HELP文件中对几个模块的概括： CASTEP - First-principles plane-wave pseudopotential code for quantum mechanics-based simulation of solid-state materials. DFTB+ - A density functional based tight binding (DFTB) tool that allows you to investigate the energy, structure, and dynamics of a wide range of systems. Atomic parameter sets are used to represent the electronic and repulsive energy contributions to the model. DMol3 - A unique density functional theory quantum mechanical package that can simulate processes for nonperiodic structures in gas phase, solvent, surface, and solid environments. DMol3 also includes calculations on periodic structures. ONETEP - A revolutionary quantum mechanics-based program designed specifically for calculations on large systems that employs density functional theory in the density matrix formulation. 这里先抛砖了。如果举个些例子的话，CASTEP啥都能算算，就是体系大了需要的计算量会猛增，上百甚至几百原子的模型计算起来简直望穿秋水。DMol3，可以算非周期体系，小型周期体系算起来速度甚至不及CASTEP(用MgO测过)。ONETEP，最近才学习这个，直接感受就是快，计算量消耗和原子个数，核心数呈线性相关。DFTB+还没仔细研究。 请大家随便说说吧，非常渴望听听大家的直观感受或者理论啥都可以。 |
回复此楼» 猜你喜欢
假如你的研究生提出不合理要求
已经有12人回复
-
实验室接单子
已经有7人回复
-
全日制（定向）博士
已经有5人回复
-
萌生出自己或许不适合搞科研的想法，现在跑or等等看？
已经有4人回复
-
Materials Today Chemistry审稿周期
已经有4人回复
-
参与限项
已经有3人回复
-
对氯苯硼酸纯化
已经有3人回复
-
所感
已经有4人回复
-
要不要辞职读博？
已经有7人回复
-
北核录用
已经有3人回复
纳米之心
木虫 (文坛精英)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 3978.7
- 散金: 4216
- 红花: 25
- 帖子: 12436
- 在线: 339.5小时
- 虫号: 2445904
- 注册: 2013-05-03
- 专业: 细胞信号转导
2楼2015-10-23 19:24:51
tuhao2004
木虫 (正式写手)
- 应助: 22 (小学生)
- 金币: 3637.6
- 散金: 38
- 红花: 7
- 帖子: 604
- 在线: 160.2小时
- 虫号: 975757
- 注册: 2010-03-19
- 性别: GG
- 专业: 无机非金属基复合材料
3楼2015-10-23 20:19:31
lastzealot
新虫 (著名写手)
【乱世的奸雄】
- 应助: 87 (初中生)
- 金币: 2684.9
- 散金: 876
- 红花: 24
- 帖子: 2920
- 在线: 212.3小时
- 虫号: 730090
- 注册: 2009-03-24
- 性别: GG
- 专业: 高分子材料结构与性能
4楼2015-10-23 20:24:24
tuhao2004
木虫 (正式写手)
- 应助: 22 (小学生)
- 金币: 3637.6
- 散金: 38
- 红花: 7
- 帖子: 604
- 在线: 160.2小时
- 虫号: 975757
- 注册: 2010-03-19
- 性别: GG
- 专业: 无机非金属基复合材料
5楼2015-10-23 21:53:16
lastzealot
新虫 (著名写手)
【乱世的奸雄】
- 应助: 87 (初中生)
- 金币: 2684.9
- 散金: 876
- 红花: 24
- 帖子: 2920
- 在线: 212.3小时
- 虫号: 730090
- 注册: 2009-03-24
- 性别: GG
- 专业: 高分子材料结构与性能
6楼2015-10-23 22:16:50
卡开发发
专家顾问 (著名写手)
Ab Initio Amateur
-
专家经验: +224 - 1ST强帖: 2
- 应助: 47 (小学生)
- 金币: 3492.8
- 散金: 14
- 红花: 223
- 帖子: 2477
- 在线: 1253.7小时
- 虫号: 1369423
- 注册: 2011-08-16
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的磨损与磨蚀
- 管辖: 第一性原理
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
tuhao2004: 金币+10 2015-10-24 11:08:55
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
tuhao2004: 金币+10 2015-10-24 11:08:55
|
涉及到的具体理论翻出来说意思不大，说说直观感受了。 castep计算低维体系几乎没啥优势，box大一点计算量就能够大不少，比较适合box不太大，k比较密集的情况。尤其是跨节点并行，节点数和k正相关的时候并行效率极高。整个程序的处理方式比较严谨，精度也比较高，新的otfg赝势据说相当准确（没做过相关验证）变胞优化比较准确，遗憾的是新的一些方法都没有实现。还有，虚晶近似大概也只有castep能做，这点对于无序体系相当重要。 DMol3计算量几乎仅仅与原子数相关（严格说是基函数的数目），只有Ewald求和的部分与晶格大小有关。跨节点并行效率不如castep，但也不像castep那样依赖k点。DSPP的模守恒赝势质量也挺高。方法比castep更少，加上波函数文件是封装加密的，能够自己写脚本分析的只有电荷的格点文件，这些在使用过程中都会感觉相当受限。 ONETEP不算很熟悉，据说是线性标度程序，似乎是因为采用的是Wannier函数的原因，必须使用超胞方法来进行计算以及模守恒赝势（实空间）。能计算的性质似乎也寥寥无几，并行效率没测试过。 DFTB+属于半经验的TB方法，计算速度很快。SCC的方案我不是很熟悉，方法方面就不说了。有开源的版本，但是要在官网申请，SK参数库官网上更全面。MS-DFTB+似乎不支持跨节点并行，几次尝试都报错了。 可能还有更多的细节一时半会也就想不起那么多了。 |
7楼2015-10-24 10:20:26
tuhao2004
木虫 (正式写手)
- 应助: 22 (小学生)
- 金币: 3637.6
- 散金: 38
- 红花: 7
- 帖子: 604
- 在线: 160.2小时
- 虫号: 975757
- 注册: 2010-03-19
- 性别: GG
- 专业: 无机非金属基复合材料
8楼2015-10-24 11:08:57
tuhao2004
木虫 (正式写手)
- 应助: 22 (小学生)
- 金币: 3637.6
- 散金: 38
- 红花: 7
- 帖子: 604
- 在线: 160.2小时
- 虫号: 975757
- 注册: 2010-03-19
- 性别: GG
- 专业: 无机非金属基复合材料
9楼2015-10-26 09:55:04