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tuhao2004

木虫 (正式写手)

[交流] 聊一聊MS中几个DFT模块的优势和缺陷?

以下是HELP文件中对几个模块的概括:
CASTEP - First-principles plane-wave pseudopotential code for quantum mechanics-based simulation of solid-state materials.
DFTB+ - A density functional based tight binding (DFTB) tool that allows you to investigate the energy, structure, and dynamics of a wide range of systems. Atomic parameter sets are used to represent the electronic and repulsive energy contributions to the model.
DMol3 - A unique density functional theory quantum mechanical package that can simulate processes for nonperiodic structures in gas phase, solvent, surface, and solid environments. DMol3 also includes calculations on periodic structures.
ONETEP - A revolutionary quantum mechanics-based program designed specifically for calculations on large systems that employs density functional theory in the density matrix formulation.
这里先抛砖了。如果举个些例子的话,CASTEP啥都能算算,就是体系大了需要的计算量会猛增,上百甚至几百原子的模型计算起来简直望穿秋水。DMol3,可以算非周期体系,小型周期体系算起来速度甚至不及CASTEP(用MgO测过)。ONETEP,最近才学习这个,直接感受就是快,计算量消耗和原子个数,核心数呈线性相关。DFTB+还没仔细研究。
请大家随便说说吧,非常渴望听听大家的直观感受或者理论啥都可以。
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纳米之心

木虫 (文坛精英)

祝福楼主
火星人要回火星了!!!
2楼2015-10-23 19:24:51
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tuhao2004

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 纳米之心 at 2015-10-23 19:24:51
祝福楼主

大哥,此话甚有深意啊,难道作为学生我帖子开的太大太空了。
3楼2015-10-23 20:19:31
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lastzealot

新虫 (著名写手)

【乱世的奸雄】


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这几个板块最大的问题就是太贵

发自小木虫Android客户端
4楼2015-10-23 20:24:24
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tuhao2004

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lastzealot at 2015-10-23 20:24:24
这几个板块最大的问题就是太贵

现在手上一个工作用了两个,都不敢跟老板谈要钱这个事。
5楼2015-10-23 21:53:16
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lastzealot

新虫 (著名写手)

【乱世的奸雄】


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by tuhao2004 at 2015-10-23 21:53:16
现在手上一个工作用了两个,都不敢跟老板谈要钱这个事。...

给搞计算的人挂名就不用买

发自小木虫Android客户端
6楼2015-10-23 22:16:50
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
tuhao2004: 金币+10 2015-10-24 11:08:55
涉及到的具体理论翻出来说意思不大,说说直观感受了。

castep计算低维体系几乎没啥优势,box大一点计算量就能够大不少,比较适合box不太大,k比较密集的情况。尤其是跨节点并行,节点数和k正相关的时候并行效率极高。整个程序的处理方式比较严谨,精度也比较高,新的otfg赝势据说相当准确(没做过相关验证)变胞优化比较准确,遗憾的是新的一些方法都没有实现。还有,虚晶近似大概也只有castep能做,这点对于无序体系相当重要。

DMol3计算量几乎仅仅与原子数相关(严格说是基函数的数目),只有Ewald求和的部分与晶格大小有关。跨节点并行效率不如castep,但也不像castep那样依赖k点。DSPP的模守恒赝势质量也挺高。方法比castep更少,加上波函数文件是封装加密的,能够自己写脚本分析的只有电荷的格点文件,这些在使用过程中都会感觉相当受限。

ONETEP不算很熟悉,据说是线性标度程序,似乎是因为采用的是Wannier函数的原因,必须使用超胞方法来进行计算以及模守恒赝势(实空间)。能计算的性质似乎也寥寥无几,并行效率没测试过。

DFTB+属于半经验的TB方法,计算速度很快。SCC的方案我不是很熟悉,方法方面就不说了。有开源的版本,但是要在官网申请,SK参数库官网上更全面。MS-DFTB+似乎不支持跨节点并行,几次尝试都报错了。

可能还有更多的细节一时半会也就想不起那么多了。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
7楼2015-10-24 10:20:26
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tuhao2004

木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 卡开发发 at 2015-10-24 10:20:26
涉及到的具体理论翻出来说意思不大,说说直观感受了。

castep计算低维体系几乎没啥优势,box大一点计算量就能够大不少,比较适合box不太大,k比较密集的情况。尤其是跨节点并行,节点数和k正相关的时候并行效率极 ...

谢谢一下子说了这么多,受教了。
8楼2015-10-24 11:08:57
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tuhao2004

木虫 (正式写手)

自己顶自己一记,还想多学学经验啦。
9楼2015-10-26 09:55:04
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