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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » ChemOffice » 在Chem3D中如何进行分子模拟和分子对接？
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铁剑琴心

荣誉版主 (著名写手)

[交流] 在Chem3D中如何进行分子模拟和分子对接？

各位虫G虫J，弱弱地请教一个问题，在Chem3D中如何进行分子模拟和分子对接、并导入到Gaussian计算？谢谢啦！

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-26 at 14:30 ]
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1楼 2008-09-07 23:09:36
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢你的解答
Structure-dock进行对接，不考虑能量，只考虑距离的设定进行简单的对接。
chem3D提供的分子动力学模拟基本没有意义，不建议用。
接口在calculation-gaussian interface
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3楼2008-09-08 10:00:19
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nh13

木虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
分子对接好像不行，高斯的接口倒是有。
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2楼2008-09-08 08:32:11
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铁剑琴心

荣誉版主 (著名写手)
谢谢楼上的朋友，我也感觉Chem3D的MD精度不够，每次拟合结果够不一样。
继续真诚请教，在Gaussian中如何对接分子呢？
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4楼2008-09-08 14:47:15
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