| 查看: 19948 | 回复: 2 | |||
[求助]
微生物的群落丰富度和群落多样性有什么差别？已有1人参与
|
|
群落丰富度（Community richness）的指数，包括Chao 指数和ACE 指数 Chao指数：是用Chao1 算法估计样品中所含OTU 数目的指数，Chao1 在生态学中常用来估计物种总数，由Chao（Pitta DW等，2010）最早提出。 ACE指数：用来估计群落中OTU数目的指数，由Chao提出，是生态学中估计物种总数的常用数之一，与Chao1的算法不同（Pitta DW等,2010）。 Chao 或ACE指数越大，说明群落丰富度越高。 群落多样性（Community diversity）的指数，包括Shannon 指数和Simpson指数。 Shannon指数：用来估算样品中微生物多样性指数之一。它与Simpson多样性指数常用于反映alpha多样性指数。Shannon值越大，说明群落多样性越高。 Simpsin指数：用来估算样品中微生物多样性指数之一，由Edward Hugh Simpson提出，在生态学中常用来定量描述一个区域的生物多样性。Simpson指数值越大，说明群落多样性越低。 但是这四个指数分析出来的结果有差异，想请问各位前辈，应该以哪个为准？群落丰富度和群落多样性是一个意思吗？麻烦告知一下~~ |
回复此楼» 猜你喜欢
博士读完未来一定会好吗
已经有6人回复
-
小论文投稿
已经有3人回复
-
Bioresource Technology期刊，第一次返修的时候被退回好几次了
已经有9人回复
-
心脉受损
已经有3人回复
-
到新单位后，换了新的研究方向，没有团队，持续积累2区以上论文，能申请到面上吗
已经有8人回复
-
申请2026年博士
已经有6人回复
-
请问哪里可以有青B申请的本子可以借鉴一下。
已经有5人回复
2楼2015-10-17 10:01:24
xiaoma0556
木虫 (正式写手)
- MicEPI: 1
- 应助: 28 (小学生)
- 金币: 4819.5
- 散金: 2717
- 红花: 4
- 帖子: 567
- 在线: 527小时
- 虫号: 875241
- 注册: 2009-10-17
- 专业: 环境微生物学
【答案】应助回帖
|
丰度和多样性当然不一样 丰度指的是你这里面有多少类的菌，丰度越高，微生物种类越多，越丰富，正常情况下Chao1和OTU的趋势一致 Shannon和 Simpsin的数值是相反的关系，多样性指的是每个菌分布的均匀度，说一个shannon即可，大体上shannon指数和OTU数有一定的正相关吧，趋势没有完全一致的，都没啥关系，该是多少是多少。 可参考我的文章，http://www.sciencedirect.com/sci ... i/S0960852414017866 |
3楼2015-12-23 17:04:31