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微生物的群落丰富度和群落多样性有什么差别？ 已有1人参与
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群落丰富度（Community richness）的指数，包括Chao 指数和ACE 指数 Chao指数：是用Chao1 算法估计样品中所含OTU 数目的指数，Chao1 在生态学中常用来估计物种总数，由Chao（Pitta DW等，2010）最早提出。 ACE指数：用来估计群落中OTU数目的指数，由Chao提出，是生态学中估计物种总数的常用数之一，与Chao1的算法不同（Pitta DW等,2010）。 Chao 或ACE指数越大，说明群落丰富度越高。 群落多样性（Community diversity）的指数，包括Shannon 指数和Simpson指数。 Shannon指数：用来估算样品中微生物多样性指数之一。它与Simpson多样性指数常用于反映alpha多样性指数。Shannon值越大，说明群落多样性越高。 Simpsin指数：用来估算样品中微生物多样性指数之一，由Edward Hugh Simpson提出，在生态学中常用来定量描述一个区域的生物多样性。Simpson指数值越大，说明群落多样性越低。 但是这四个指数分析出来的结果有差异，想请问各位前辈，应该以哪个为准？群落丰富度和群落多样性是一个意思吗？麻烦告知一下~~ |
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2楼2015-10-17 10:01:24
xiaoma0556
木虫 (正式写手)
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【答案】应助回帖
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丰度和多样性当然不一样 丰度指的是你这里面有多少类的菌，丰度越高，微生物种类越多，越丰富，正常情况下Chao1和OTU的趋势一致 Shannon和 Simpsin的数值是相反的关系，多样性指的是每个菌分布的均匀度，说一个shannon即可，大体上shannon指数和OTU数有一定的正相关吧，趋势没有完全一致的，都没啥关系，该是多少是多少。 可参考我的文章，http://www.sciencedirect.com/sci ... i/S0960852414017866 |
3楼2015-12-23 17:04:31
