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新虫 (初入文坛)

[求助] 怎么由VASP算出的分子动力学模拟结果提取径向分布函数RDF

各位虫友大神,求帮忙啊。
我最近在用VASP算分子动力学,结果要分析径向分布函数,要做出RDF图,可是我真的不会啊,求大神们可以指点下我啊,越详细越好啊,拜托拜托了!
应该用什么参数提取,怎么获取呢????
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elfyu

新虫 (初入文坛)

您好 我也是非晶材料的计算方向 AIMD初学者一名,有些问题想向您请教。我看文献,里面说:故首先让体系在2000 K 下运行2000 个离子步, 然后依次降温, 在1700 K, 1500 K, 1300 K,1200 K, 1100 K, 1000 K, 900 K, 800 K, 700 K, 600K, 500 K, 400 K 和300 K 下分别运行2000 个离子步后获得非晶态结构,同时调整模拟盒子的大小保持压强为0 GPa. 每个温度下, 使用最后1000 个构型进行结构分析. 请问您,1. 使用NVT系综,设置SMASS=0,是否意味着T保持不变,TEBEG要等于TEEND?2.降温时候用如何设置?SMASS=-1?3. 里面的“调整模拟盒子的大小保持压强为0 GPa“如何设置?4. 此外,“每个温度下, 使用最后1000 个构型进行结构分析”这就话什么含义,我不是很明白;5. 最后,请问如何分析键对和维诺多面体?希望您能指点指点,谢谢!!
2楼2019-10-20 14:00:44
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