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用gaussian计算原子ESP或RESP电荷,如何指定原子半径?
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计算一些含多个Fe Co Cu Cr Mo W等金属MOF的ESP电荷,不知道如何指定原子半径? 原子不同或者使用的基组(比如用SDD或者SBKJC基组)不同的话,原子半径是否也不相同? 另外,如果想计算它们的RESP charge,是否直接用Gaussian的输出文件, antechamber -i MOF.log -fi gout -o MOF.mol2 -fo mol2 -c resp -nc ${total chage} -s 2 就可以了?我已经试过antechamber,但得到的结果比较奇怪,不知道是哪儿的问题? 我的gussian(gjf)输入文件是: %Mem=4GB %nprocshared=12 %chk=test.chk #P B3LYP/Gen Integral=Ultrafine Pseudo=Read SCF(Conver=8,XQC,MaxConventionalCycles=64,MaxCycle=128) NoSymm Test 5D 7F Pop=(chelpg,ReadRadii,Regular) IOp(6/33=2) GFinput GFprint 电荷 自旋多重度 原子坐标 ... ... P C N O 0 6-31G(d) **** Fe Cr W 0 CEP-31G **** Fe Cr W 0 CEP-31G Fe 1.8 Cr 1.8 W 1.8 另外,我也没有重复出别人报导同一分子,都采用SBKJC+(df)的电子能量:我的结果是-4000 au,他们的是-1000au 不知道我的gjf文件有无明显问题? 非常感谢! |
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