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zhang_jaj木虫 (正式写手)
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[求助]
Dynamics Matrix-Hessian Matrix-vabriation density of state
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最近看到一些文献使用一个初始的构型，经过Steepest descent 或者conjugate gradient方法得到local minimum state。然后将这个state通过diagonalised dynamical matrix 或者diagonalised Hessian Matrix 后得到关于体系中N个particles的本征向量。 请问这个过程到底是怎么实现的，虽然知道这里的Hessian Matrix是势能关于每个粒子位置ri的二阶导数，但是还是比较迷茫，具体过程是怎样的。谁能帮忙解惑啊，非常感谢！ 搜索后发现貌似和MS里面的DMol3计算振动频率的方法很像，不过我要得到的是最后每个particle的本征矢量。 |
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